检索范围：
排序： 展示方式：
Culturomics and metagenomics: In understanding of environmental resistome
Monika Nowrotek, Łukasz Jałowiecki, Monika Harnisz, Grażyna Anna Płaza
《环境科学与工程前沿（英文）》 2019年 第13卷 第3期 doi: 10.1007/s11783-019-1121-8
State of the art of culturomics and metagenomics to study resistome was presented. The combination of culturomics and metagenomics approaches was proposed. The research directions of antibiotic resistance study has been suggested.
关键词： Culturomics Metagenomics Antibiotic resistance Resistome
结直肠癌黏膜组织来源的大肠杆菌菌株间遗传和功能差异研究 Article
常宇骁, 李享, 丁磊, 杨超, 潘志远, 韩妮, 崔玉军, 智发朝, 杨瑞馥, 高宏,毕玉晶
《工程（英文）》 2022年 第16卷 第9期 页码 210-219 doi: 10.1016/j.eng.2021.03.028
结直肠癌是全球第三大癌症。宏基因组学已被广泛用于基于细菌属或种水平的比较来分析肠道微生物群与结直肠癌之间的关系，为结直肠癌发展中的生态失调提供了证据。然而，这种分析并不能为我们提供菌株水平的信息，进而理解一种细菌在结直肠癌发生发展中菌株水平的作用。本文利用培养组学方法分离结直肠癌黏膜样本，并选择了158株大肠杆菌，通过系统发育分析和炎症诱导实验，揭示它们在基因组学和功能上的差异。基因组比较可以将这些菌株分为5个系统群。选择代表性菌株进行THP-1细胞（人白血病单核细胞）Transwell实验以及动物实验，结果显示不同菌株经刺激后，细胞因子水平有显著性差异。进一步的生物信息学分析揭示了不同系统群间单核苷酸多态性、基因和代谢途径的不同特征，这些结果有助于了解这些菌株之间的表型差异。细菌菌株在基因组学和功能上的差异表明，菌株水平上的功能差异可以进一步了解宿主与肠道细菌的相互作用机制。
标题 作者 时间 类型 操作
Culturomics and metagenomics: In understanding of environmental resistome
Monika Nowrotek, Łukasz Jałowiecki, Monika Harnisz, Grażyna Anna Płaza
期刊论文
京公网安备 11010502051620号
