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2014 41

2013 31

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2011 30

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2009 25

2008 26

2007 35

2006 31

2005 31

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关键词

大数据 29

2020 10

数据挖掘 9

能源 9

风险分析 9

人工智能 8

智能制造 8

机器学习 7

农业科学 6

影响因素 6

环境 5

营养健康 5

ANSYS 4

分析 4

医学 4

可持续发展 4

数值模拟 4

癌症 4

隧道 4

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发生于胃和直肠细胞的临床特征以及不同部位的转移对预后的预测价值的研究 Article

吴静静, 方戴琼, 满达, 吴文瑞, 王清, 李雅婷, 叶建中, 李兰娟

《工程(英文)》 2020年 第6卷 第9期   页码 1028-1034 doi: 10.1016/j.eng.2020.06.007

摘要:

细胞是胃、直肠肿瘤中恶性程度最高的病理类型之一。本研究分析细胞转移特性及其对肿瘤特异性生存率的影响。这项研究纳入了4055例在2010—2012年被诊断为胃细胞(signet ring cell carcinoma, SRCC)、直肠细胞患者,其中胃细胞2905例,结肠细胞直肠细胞所有临床数据来源于癌症监测、流行病学、最终结果登记资料数据SEER)。我们通过卡方检验分析在确诊时伴有远处转移的患者及无远处转移的患者的临床特征。而在患有结肠或直肠细胞患者中,肝脏是其最常见的转移部位,而在确诊时出现远处淋巴结转移的患者的拥有最高的死亡率。总之,出现远处转移常常是预后较差的标志之一,我们的研究结果为细胞患者的临床随访、预后分析提供一定的建议。

关键词: SEER数据生存分析细胞转移直肠胃癌    

转移直肠治疗模式随时间的变化趋势以及其与患者生存期的关系——一项基于智能大数据平台的回顾性队列研究 Article

王梓贤, 姚逸尘, 麦宗炯, 林武豪, 黄酉生, 金颖, 骆卉妍, 张东生, 王风华, 王峰, 陈功, 丁培荣, 元云飞, 李宇红, 黄金华, 潘志忠, 徐瑞华

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第4期   页码 526-533 doi: 10.1016/j.eng.2020.10.017

摘要:

目前,尤其是在国内,仍缺乏大规模的、高质量的转移直肠(metastatic colorectal cancer, mCRC)真实世界数据。目前尚不清楚在真实世界临床实践中提高mCRC患者的治疗质量能否为我国mCRC患者带来生存获益。基于智能大数据平台,我们建立了一个大样本的mCRC回顾性队列。我们分析了全身性治疗及局部治疗手段[包括肝转移、肺转移或肝外和(或)肺外转移灶的手术切除、射频消融以及立体定向放疗]随年份的变化趋势,以及分析了这些改变是否可改善患者的总生存期(overall survival综上,本队列研究表明mCRC全身性治疗及局部治疗的使用率的提高可以为患者带来生存获益。

关键词: 转移直肠     真实数据证据     治疗模式     生存    数据平台    

肠道不同解剖部位的菌群组成及其在直肠中的作用

赵浏阳, 张翔, 左涛, 于君

《工程(英文)》 2017年 第3卷 第1期   页码 90-97 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.012

摘要:

直肠是由遗传突变、表观遗传改变、慢性炎症、饮食和生活方式等多因素引起的多阶段疾病。最新研究表明,肠道菌群是直肠发展过程中的重要参与者。肠道菌群稳态的失调,可通过诱发炎症、调控宿主防御、氧化应激和改变细菌代谢产物等机制促进直肠的发生发展。值得注意的是,肠道横、纵截面上不同解剖部位的驻留菌群有所不同。由于结肠共生细菌的易位与直肠的发展密切相关,直肠相关细菌可有望成为用于直肠诊断的非侵入且准确性高的新型生物标志物。本文旨在总结和概述肠道不同解剖部位中的肠道菌群在直肠发生发展中的作用。

关键词: 菌群     直肠     肠腔共生菌     易位     生物标志物    

直肠、基质和正常结肠黏膜显微解剖区域N-糖组的显著多样性 Article

Di Wang, Katarina Madunić , Tao Zhang, Guinevere S.M. Lageveen-Kammeijer, Manfred Wuhrer

《工程(英文)》 2023年 第26卷 第7期   页码 32-43 doi: 10.1016/j.eng.2022.08.016

摘要:

Aberrant glycosylation is considered to be a hallmark of colorectal cancer (CRC), as demonstrated by various studies. While the N-glycosylation of cell lines and serum has been widely examined, the analysis of cancer-associated N-glycans from tissues has been hampered by the heterogeneity of tumors and the complexity of N-glycan structures. To overcome these obstacles, we present a study using laser capture microdissection that makes it possible to largely deconvolute distinct N-glycomic signatures originating from different regions of heterogeneous tissues including cancerous, stromal, and healthy mucosa cells. N-glycan alditols were analyzed by means of porous graphitized carbon liquid chromatography-electrospray ionization tandem mass spectrometry, enabling the differentiation and structural characterization of isomeric species. In total, 116 N-glycans were identified that showed profound differences in expression among cancer, stroma, and normal mucosa. In comparison with healthy mucosa, the cancer cells showed an increase in α2-6 sialylation and monoantennary N-glycans, as well as a decrease in bisected N-glycans. Moreover, specific sialylated and (sialyl-)LewisA/X antigen-carrying N-glycans were exclusively expressed in cancers. In comparison with cancer, the stroma showed lower levels of oligomannosidic and monoantennary N-glycans, LewisA/X epitopes, and sulfation, as well as increased expression of (core-)fucosylation and α2-3 sialylation. Our study reveals the distinct N-glycomic profiles of different cell types in CRC tumor and control tissues, proving the necessity of their separate analysis for the discovery of cancer-associated glycans.

 

关键词: 直肠     肿瘤     多孔石墨化碳液相色谱-质谱     N-糖组     抗体反应    

直肠黏膜组织来源的大肠杆菌菌株间遗传和功能差异研究 Article

常宇骁, 李享, 丁磊, 杨超, 潘志远, 韩妮, 崔玉军, 智发朝, 杨瑞馥, 高宏,毕玉晶

《工程(英文)》 2022年 第16卷 第9期   页码 210-219 doi: 10.1016/j.eng.2021.03.028

摘要:

直肠是全球第三大癌症。宏基因组学已被广泛用于基于细菌属或种水平的比较来分析肠道微生物群与直肠之间的关系,为直肠发展中的生态失调提供了证据。然而,这种分析并不能为我们提供菌株水平的信息,进而理解一种细菌在直肠发生发展中菌株水平的作用。本文利用培养组学方法分离直肠黏膜样本,并选择了158株大肠杆菌,通过系统发育分析和炎症诱导实验,揭示它们在基因组学和功能上的差异。基因组比较可以将这些菌株分为5个系统群。选择代表性菌株进行THP-1细胞(人白血病单核细胞)Transwell实验以及动物实验,结果显示不同菌株经刺激后,细胞因子水平有显著性差异。

关键词: 直肠     肠道菌群     培养组学     大肠杆菌     菌株水平    

直肠细胞和组织样本释放的外泌体中检测肿瘤相关抗原自身抗体的多路生物传感诊断平台展示了对直肠的高诊断能力 Article

Ana Montero-Calle, Itziar Aranguren-Abeigon, María Garranzo-Asensio, Carmen Poves, María Jesús Fernández-Aceñero, Javier Martínez-Useros, Rodrigo Sanz, Jana Dziaková, Javier Rodriguez-Cobos, Guillermo Solís-Fernández, Eloy Povedano, Maria Gamella, Rebeca Magnolia Torrente-Rodríguez, Miren Alonso-Navarro, Vivian de los Ríos, J. Ignacio Casal, Gemma Domínguez, Ana Guzman-Aranguez, Alberto Peláez-García, José Manuel Pingarrón, Susana Campuzano, Rodrigo Barderas

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第10期   页码 1393-1412 doi: 10.1016/j.eng.2021.04.026

摘要: font-family:等线">直肠CRC患者的5年生存率与诊断分期息息相关。CRC早期诊断患者的5年生存率高于80%,CRC晚期诊断患者的5年生存率低于10%。为此,我们从CRC患者体内提取5个CRC细胞系和组织样本,通过免疫沉淀-质谱分析法测量其分泌的外泌体的蛋白质含量,共鉴定出103种蛋白质为潜在的CRC特异性自身抗原。采用生物信息学技术和荟萃分析,我们选定了15种与实际CRC自身抗原类似度更高的蛋白质,以便后续借助蛋白质印迹法(WB)和免疫组织化学技术(IHC)评估它们在CRC预后中的作用。能够有效筛查区分CRC患者、前病变个体与健康个体。

关键词: 自身抗体     诊断     直肠     外泌体     肿瘤微环境     体液免疫应答     即时医疗     生物传感器    

面向金融场景的下一代数据测试基准研究

荆一楠 ,张寒冰,李智鑫 ,王晓阳 ,吴杰,柴洪峰

《中国工程科学》 2022年 第24卷 第4期   页码 121-132 doi: 10.15302/J-SSCAE-2022.04.014

摘要: 为此,结合金融行业的数据应用发展需求,本文通过采用文献调研和理论分析等方法,全面分析了银行数据 的应用现状,特别是近几年数据国产化替代的情况与面临的挑战,系统调研了国内外主要的数据测试基准,展望了构例如,针对需要分析多层交易记录路径的贷款风险计算场景,将账户及交易记录等数据转换为图数据并使用图数据(如Neo4j)来对这些数据进行存储和分析,能够比关系型数据更加快速地获得任务结果。例如,针对社交网络中的数据分析任务,使用以Neo4j为代表的图数据能够比传统关系型数据更好地表征数据关系;而针对海量数据分析需求,选用分布式数据更能有效应对大数据和高并发的请求处理。面向分析数据的测试基准

为提高分析效率和决策效果,一般通过建立数据仓库等方式来支持对大规模数据进行复杂的分析处理,因此OLAP数据更关注复杂查询和聚集分析,侧重决策支持。本文选取了4类较为典型的NoSQL数据测试基准进行分析介绍。

关键词: 金融业     银行     金融数据     数据     测试基准    

中国优秀博硕士学位论文全文数据(CDMD)总体介绍

《中国工程科学》 2002年 第4卷 第8期   页码 94-94

具有冗余结构的分布式数据服务器及其负载平衡模型

田俊峰,刘玉玲,杜瑞忠

《中国工程科学》 2004年 第6卷 第6期   页码 35-42

摘要: 介绍了一种分布式数据服务器的构成原理及工作模型,重点讨论了它的冗余关系、基于移动代理的负载平衡模型及其性能分析等。

关键词: 分布式数据     冗余     负载平衡     移动代理     性能分析    

数据存储技术综述 Review

Aisha SIDDIQA, Ahmad KARIM, Abdullah GANI

《信息与电子工程前沿(英文)》 2017年 第18卷 第8期   页码 1040-1070 doi: 10.1631/FITEE.1500441

摘要: 对于容量快速增长、日趋多元化的大数据,业界亟需开发可行性更好的存储工具。为满足大数据存储需求,存储机制已经形成从传统数据管理系统到NoSQL技术的结构化转移。然而,目前可用的大数据存储技术无法为持续增长的异构数据提供一致、可扩展和可用的解决方案。在科学实验、医疗保健、社交网络和电子商务等实际应用中,存储是大数据分析的第一步。截至目前,亚马逊、谷歌和阿帕奇等公司形成了大数据存储方案的行业标准,但尚未有关于大数据存储技术性能和容量提升的深入调查和文献报告。本文旨在对目前可用于大数据的最先进的存储技术进行全面调查,提供了一个明确的大数据存储技术分类方法,以帮助数据分析师和研究人员了解和选择更适合其需求的存储机制。我们使用布鲁尔的CAP定理比较和分析了现有存储方法,评估了不同存储架构的性能,讨论了存储技术的意义、应用及其对其他类别数据的支持。

关键词: 数据;大数据存储;NoSQL数据;分布式数据;CAP定理;可扩展性;一致性-分区弹性;可用性-分区弹性    

KDD中双协同机制的研究(Ⅰ)

杨炳儒,王建新

《中国工程科学》 2002年 第4卷 第4期   页码 41-51

摘要:

针对KDD(基于数据的知识发现)主流发展中存在的典型问题提出了用知识去 制约与驱动数据, 并通过数据改善知识结构的知识发现的新思想,形成了具有双协同机制的KDD的开放系统KDD*,从而提高了知识发现的速度、精度和认知自主性,并使知识在结构上具备了实时维护与自我进化的能力,同时阐述了作为双协同基础的数据和知识在本质上的对应关系。

关键词: 知识结点     本原知识     本原数据     数据子类结构     协同机制    

基于r-子团最小覆盖的图结构数据高效关键字搜索 Article

Asieh GHANBARPOUR, Khashayar NIKNAFS, Hassan NADERI

《信息与电子工程前沿(英文)》 2020年 第21卷 第3期   页码 448-464 doi: 10.1631/FITEE.1800133

摘要: 对图结构数据的查询,关键字搜索是结构化查询语言的一种替代方式。关键字查询的结果是图结构数据上一个连接的结构,其覆盖所有或部分关键字。文本覆盖率和结构紧凑性是评价关键字查询结果是否相关的两个主要属性。基于两个真实数据集的大量实验验证了所提算法的效率和有效性。

关键词: 关键字搜索;图挖掘;信息检索;数据;子团    

ARGs-OAP v3.0——抗生素耐药基因数据的筛选和分析流程优化 Article

Xiaole Yin, Xiawan Zheng, Liguan Li, An-Ni Zhang, Xiao-Tao Jiang, Tong Zhang

《工程(英文)》 2023年 第27卷 第8期   页码 234-241 doi: 10.1016/j.eng.2022.10.011

摘要:

Antibiotic resistance, which is encoded by antibiotic-resistance genes (ARGs), has proliferated to become a growing threat to public health around the world. With technical advances, especially in the popularization of metagenomic sequencing, scientists have gained the ability to decipher the profiles of ARGs in diverse samples with high accuracy at an accelerated speed. To analyze thousands of ARGs in a highthroughput way, standardized and integrated pipelines are needed. The new version (v3.0) of the widely used ARGs online analysis pipeline (ARGs-OAP) has made significant improvements to both the reference database—the structured ARGs (SARG) database—and the integrated analysis pipeline. SARG has been enhanced with sequence curation to improve annotation reliability, incorporate emerging resistance genotypes, and determine rigorous mechanism classification. The database has been further organized and visualized online in the format of a tree-like structure with a dictionary. It has also been divided into sub-databases for different application scenarios. In addition, the ARGs-OAP has been improved with adjusted quantification methods, simplified tool implementation, and multiple functions with userdefined reference databases. Moreover, the online platform now provides a diverse biostatistical analysis workflow with visualization packages for the efficient interpretation of ARG profiles. The ARGs-OAP v3.0 with an improved database and analysis pipeline will benefit academia, governmental management, and consultation regarding risk assessment of the environmental prevalence of ARGs.

关键词: SARG database ARGs-OAP     Antibiotic-resistance genes     Environmental metagenome     Quantification    

数据标识编码——连接材料基因组工程数据与可传承集成智能制造的桥梁 Perspective

王毅, 李佩璇, 林徳烨, 唐斌, 王军, 管全梅, 叶谦, 代海星, 高军, 范晓丽, 寇宏超, 宋海峰, 周峰, 马纪军, 刘梓葵, 李金山, 刘维民

《工程(英文)》 2020年 第6卷 第6期   页码 612-620 doi: 10.1016/j.eng.2020.05.001

摘要:

数据标识符(DID)是所有类型数据中必不可少的标签,尤其是与集成计算材料工程(ICME)、可传承集成智能制造(I3M)和工业物联网有关的数据依据全球多个官方文件的展望蓝图的指引和先进材料的快速发展,需要进行更多的研究工作来建立材料信息学的相关数据标准。包括汉信码(Hanxin Code)、龙贝(Lots Perception Matrix, LP)码、快速反应(Quick Response, QR)码、网格矩阵(Grid Matrix, GM)码和数据矩阵通过将这些二维码作为一组与云平台相连的数据指纹,人们可以自动跟踪成分-工艺-结构-性能-服役全流程中的进度和更新,为加速先进材料的发现和制造以及提高研究产出、效能和协作铺平道路。

关键词: 数据标识符     数据     数字孪生     集成计算材料工程    

用于定义系统表现特征的基因型与表型仓库数据的信息图式构造方法 Article

Shahab POURTALEBI,Imre HORVÁTH

《信息与电子工程前沿(英文)》 2016年 第17卷 第9期   页码 862-884 doi: 10.1631/FITEE.1600997

摘要: 因此,我们提出了一种基于信息模式构造(information schema construct, ISC)的方法用以构造相关联的仓库数据图式以及前述的SMF。ISC从逻辑上将SMF的数据内容整合为一组不同语义下的关系表。本文中我们给出了创建基因型和表型所必需的信息模式构造。这些信息模式构造提高了数据的开发效率,并使数据之间的联系透明化。

关键词: 信息物理系统;软件工具箱;预实体化设计;系统表现特征;仓库;数据图式;基因型系统表现特征;表型系统表现特征;实例系统表现特征;信息模式构造    

标题 作者 时间 类型 操作

发生于胃和直肠细胞的临床特征以及不同部位的转移对预后的预测价值的研究

吴静静, 方戴琼, 满达, 吴文瑞, 王清, 李雅婷, 叶建中, 李兰娟

期刊论文

转移直肠治疗模式随时间的变化趋势以及其与患者生存期的关系——一项基于智能大数据平台的回顾性队列研究

王梓贤, 姚逸尘, 麦宗炯, 林武豪, 黄酉生, 金颖, 骆卉妍, 张东生, 王风华, 王峰, 陈功, 丁培荣, 元云飞, 李宇红, 黄金华, 潘志忠, 徐瑞华

期刊论文

肠道不同解剖部位的菌群组成及其在直肠中的作用

赵浏阳, 张翔, 左涛, 于君

期刊论文

直肠、基质和正常结肠黏膜显微解剖区域N-糖组的显著多样性

Di Wang, Katarina Madunić , Tao Zhang, Guinevere S.M. Lageveen-Kammeijer, Manfred Wuhrer

期刊论文

直肠黏膜组织来源的大肠杆菌菌株间遗传和功能差异研究

常宇骁, 李享, 丁磊, 杨超, 潘志远, 韩妮, 崔玉军, 智发朝, 杨瑞馥, 高宏,毕玉晶

期刊论文

直肠细胞和组织样本释放的外泌体中检测肿瘤相关抗原自身抗体的多路生物传感诊断平台展示了对直肠的高诊断能力

Ana Montero-Calle, Itziar Aranguren-Abeigon, María Garranzo-Asensio, Carmen Poves, María Jesús Fernández-Aceñero, Javier Martínez-Useros, Rodrigo Sanz, Jana Dziaková, Javier Rodriguez-Cobos, Guillermo Solís-Fernández, Eloy Povedano, Maria Gamella, Rebeca Magnolia Torrente-Rodríguez, Miren Alonso-Navarro, Vivian de los Ríos, J. Ignacio Casal, Gemma Domínguez, Ana Guzman-Aranguez, Alberto Peláez-García, José Manuel Pingarrón, Susana Campuzano, Rodrigo Barderas

期刊论文

面向金融场景的下一代数据测试基准研究

荆一楠 ,张寒冰,李智鑫 ,王晓阳 ,吴杰,柴洪峰

期刊论文

中国优秀博硕士学位论文全文数据(CDMD)总体介绍

期刊论文

具有冗余结构的分布式数据服务器及其负载平衡模型

田俊峰,刘玉玲,杜瑞忠

期刊论文

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Aisha SIDDIQA, Ahmad KARIM, Abdullah GANI

期刊论文

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杨炳儒,王建新

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Asieh GHANBARPOUR, Khashayar NIKNAFS, Hassan NADERI

期刊论文

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Xiaole Yin, Xiawan Zheng, Liguan Li, An-Ni Zhang, Xiao-Tao Jiang, Tong Zhang

期刊论文

数据标识编码——连接材料基因组工程数据与可传承集成智能制造的桥梁

王毅, 李佩璇, 林徳烨, 唐斌, 王军, 管全梅, 叶谦, 代海星, 高军, 范晓丽, 寇宏超, 宋海峰, 周峰, 马纪军, 刘梓葵, 李金山, 刘维民

期刊论文

用于定义系统表现特征的基因型与表型仓库数据的信息图式构造方法

Shahab POURTALEBI,Imre HORVÁTH

期刊论文