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Aphanomyces euteiches ——加拿大豌豆生产的严重威胁 Review
Longfei Wu,Kan-Fa Chang,Robert L. Conner,Stephen Strelkov,Rudolph Fredua-Agyeman,Sheau-Fang Hwang,David Feindel
《工程(英文)》 2018年 第4卷 第4期 页码 542-551 doi: 10.1016/j.eng.2018.07.006
牙鲆50K SNP芯片的研制及其在抗病性状基因组选择中的应用 Article
周茜, 陈亚东, 卢昇, 刘洋, 徐文腾, 李仰真, 王磊, 王娜, 杨英明, 陈松林
《工程(英文)》 2021年 第7卷 第3期 页码 406-411 doi: 10.1016/j.eng.2020.06.017
单核苷酸多态性(SNP)芯片是一种强大的基因分型工具,用于遗传学研究和基因组选择(GS)育种。牙鲆是许多国家重要的经济养殖比目鱼品种。然而,高效基因分型工具的缺乏,严重阻碍了牙鲆基因组育种的进程。在本文中,我们研发了一款牙鲆50K“鱼芯1号”SNP芯片,并将其应用于抗病基因组选择。利用Affymetrix Axiom基因分型技术,我们从1099个个体的全基因组重测序数据中获得了超过4220万个SNP,从中选择了在基因组中均匀分布的48 697个SNP,研制成“鱼芯1号为了验证“鱼芯1号”芯片在基因组选择方面的应用效果,利用候选群体的27个个体和参考群体的931个个体的基因分型数据,计算了抗迟缓爱德华氏菌病性状的基因组估计育种值(GEBV)。综上所述,本文研制的牙鲆50K“鱼芯1号”芯片,为高质量的基因分型提供了一个有效的工具,推动了基于基因组选择的牙鲆抗病良种选育进程。
数量工程技术在南京长江隧道工程中风险辨别及事故防范的应用研究
钱维,金先龙,沈建奇
《中国工程科学》 2008年 第10卷 第10期 页码 22-30
以南京长江隧道工程为背景,提出了基于数量工程技术的风险提示及事故防范方法,即运用数值仿真方法,借助超级计算机的并行计算能力,建立盾构机进出洞,盾构机穿越长江大堤及穿越江中最浅覆土层,两台盾构机同时施工影响,盾构机穿越复合土层等工程关键问题的数量分析模型。
阮欣,阮静,陈艾荣,郭济
《中国工程科学》 2012年 第14卷 第5期 页码 71-74
在分析鞍座抗滑机理的基础上,建立了基于最大静摩擦系数的三塔悬索桥中间塔鞍座抗滑基本评估模型,并发展了多种鞍座抗滑评估方法。包括基于目前使用的设计规范评估鞍座抗滑安全的确定性方法;基于静态车辆数据合成随机车流,并利用Rice公式外推其荷载效应极值,进而研究鞍座抗滑安全性能的评估方法;以及基于车辆荷载效应和抗力概率模型的鞍座抗滑概率评估方法用上述三种方法分别对泰州大桥鞍座抗滑安全性进行全面评估,表明泰州大桥中塔鞍座抗滑安全可靠。
面向热带地区植物修复的植物性状研究 Article
Xiangting Cleo Chen, Liling Huang, Tze Hsien Agnes Chang, Bee Lian Ong, Say Leong Ong, Jiangyong Hu
《工程(英文)》 2019年 第5卷 第5期 页码 841-848 doi: 10.1016/j.eng.2019.07.019
水是一种有限而宝贵的资源。新加坡的国家水源有4种补给方式,其中之一是自然降水。雨水径流会收集污染物,并将其富集到排水系统和水库中。在当地雨水径流中发现的主要富营养污染物包括硝酸盐和磷酸盐,这些富营养污染物可能导致富营养化。在有植物存在的情况下,生物滞留系统可以有效去除这些污染物。本文探讨了植物特性对雨水径流中营养性污染物的植物修复作用,并将其应用于生物防护系统中。所研究的植物物种在叶绿素含量、叶片绿色的浓度、生物量的产生以及硝酸盐和磷酸盐去除方面表现出了差异。一般而言,干生物量与硝酸盐和磷酸盐的去除程度相关(r = 0.339~0.501)。本地树种的根、叶和总干生物量显示出与硝酸盐去除程度之间的中等至强相关性(r 分别为0.811、0.657和0.727)。速生植物的叶片干生物量与两种污染物的去除程度也显示出中等至强相关性(r 分别为0.707和0.609)。低生长植株的根系生物量与磷的去除有很强的相关性(r = 0.707),但与硝酸盐去除的相关性较弱(r = 0.557)。这些结果对于选择用于生物滞留系统的植物是有价值的。
免疫球蛋白G N-糖基化与代谢特征之间的双向因果关联——一项孟德尔随机化研究 Article
孟晓妮, 曹维杰, 刘迪, Isinta Elijah Maranga, 邢薇佳, 侯海峰, 徐希柱, 宋曼殳, 王友信
《工程(英文)》 2023年 第26卷 第7期 页码 74-88 doi: 10.1016/j.eng.2022.11.004
夏家辉
《中国工程科学》 2000年 第2卷 第11期 页码 1-11
介绍了中国医学遗传学国家重点实验室在遗传病家系收集、疾病基因定位、疾病基因克隆和疾病基因功能研究方面的研究工作。用细胞遗传学G显带技术于1975年发现了一条与鼻咽癌相关的标记染色体t(1;3)(q44;p11);1981年将睾丸决定基因(TDF)定位于Yp11.32带;1991年以来收集遗传病家系345种共590个;1996年用显微切割、PCR、微克隆技术克隆了EXT2基因;1998年用基因家族-候选疾病基因克隆方法克隆了遗传性神经性耳聋基因GJB3;1999年用连锁分析和全基因组扫描将一种遗传性弥漫性浅表性光敏性汗孔角化症定位于12q23.2带,并在基因功能研究中发现了一个新的细胞内转运蛋白。
关键词: 遗传病家系 基因定位和克隆 基因家族-候选疾病基因克隆 基因组扫描 基因功能研究
官春云
《中国工程科学》 2002年 第4卷 第8期 页码 34-39
简要介绍了国外油菜转基因育种情况,包括转除草剂抗性基因,病原菌抗性基因,耐重金属基因, 影响种子贮藏产物基因,影响繁殖特性基因,医药和工业产品基因,以及启动子调节基因等。较详细介绍了湖 南农业大学在Bt毒蛋白基因转化甘蓝型油菜育成抗虫新品系、基因工程雄性不育系、恢复系选育和杂种优势利 用,以及反义FAD2基因转化甘蓝型油菜双低品种提高油酸含量的研究结果;浙江省农科院利用反义PEP基因 转化甘蓝型油菜提高种子含油量的研究结果。
人类蛋白质N-糖基化的十二年全基因组关联研究 Review
Anna Timoshchuk, Sodbo Sharapov, Yurii S. Aulchenko
《工程(英文)》 2023年 第26卷 第7期 页码 17-31 doi: 10.1016/j.eng.2023.03.013
Most human-secreted and membrane-bound proteins have covalently attached oligosaccharide chains, or glycans. Glycosylation influences the physical and chemical properties of proteins, as well as their biological functions. Unsurprisingly, alterations in protein glycosylation have been implicated in a growing number of human diseases, and glycans are increasingly being considered as potential therapeutic targets, an essential part of therapeutics, and biomarkers. Although glycosylation pathways are biochemically well-studied, little is known about the networks of genes that guide the cell- and tissue-specific regulation of these biochemical reactions in humans in vivo. The lack of a detailed understanding of the mechanisms regulating glycome variation and linking the glycome to human health and disease is slowing progress in clinical applications of human glycobiology. Two of the tools that can provide much sought-after knowledge of human in vivo glycobiology are human genetics and genomics, which offer a powerful data-driven agnostic approach for dissecting the biology of complex traits. This review summarizes the current state of human populational glycogenomics. In Section 1, we provide a brief overview of the N-glycan's structural organization, and in Section 2, we give a description of the major blood plasma glycoproteins. Next, in Section 3, we summarize, systemize, and generalize the results from current N-glycosylation genome-wide association studies (GWASs) that provide novel knowledge of the genetic regulation of the populational variation of glycosylation. Until now, such studies have been limited to an analysis of the human blood plasma N-glycome and the N-glycosylation of immunoglobulin G and transferrin. While these three glycomes make up a rather limited set compared with the enormous multitude of glycomes of different tissues and glycoproteins, the study of these three does allow for powerful analysis and generalization. Finally, in Section 4, we turn to genes in the established loci, paying particular attention to genes with strong support in Section 5. At the end of the review, in Sections 6 and 7, we describe special cases of interest in light of new discoveries, focusing on possible mechanisms of action and biological targets of genetic variation that have been implicated in human protein N-glycosylation.
王化川,王爱玲
《中国工程科学》 2001年 第3卷 第1期 页码 83-84
论述了在AGC改造中上支承辊轴承座的改造,利用有限单元进行强度校核,并提出最优结果。
陈松林,徐文腾,陈张帆
《中国工程科学》 2019年 第21卷 第6期 页码 39-47 doi: 10.15302/J-SSCAE-2019.06.007
本文主要从基因组和转录组层面分析了极地动物基因资源的研究现状,梳理了本领域研究中存在的问题,并提出了未来发展战略。极地动物基因组测序起步较晚,迄今只完成了 13种极地动物的全基因组测序。在转录组研究方面,人们对极地的 31个物种进行了转录组测序,并在以下四个方向重点开展了研究:环境适应性研究;污染物应激反应的分子机制研究;不同发育阶段或不同组织中的转录组分析;功能基因挖掘。本领域研究由于起步晚,研究广度和深度都有待加强,但极地动物的基因资源研究具有战略意义。建议国家设立“极地动物基因资源发掘与应用”重点研发计划专项,围绕极地渔业动物特殊性状遗传解析、特有基因功能分析和基因工程产品研发等开展研究。
关键词: 极地动物 基因组,转录组,基因资源
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Aphanomyces euteiches ——加拿大豌豆生产的严重威胁
Longfei Wu,Kan-Fa Chang,Robert L. Conner,Stephen Strelkov,Rudolph Fredua-Agyeman,Sheau-Fang Hwang,David Feindel
期刊论文
面向热带地区植物修复的植物性状研究
Xiangting Cleo Chen, Liling Huang, Tze Hsien Agnes Chang, Bee Lian Ong, Say Leong Ong, Jiangyong Hu
期刊论文
免疫球蛋白G N-糖基化与代谢特征之间的双向因果关联——一项孟德尔随机化研究
孟晓妮, 曹维杰, 刘迪, Isinta Elijah Maranga, 邢薇佳, 侯海峰, 徐希柱, 宋曼殳, 王友信
期刊论文