Date:2019-08-02 08:00:00.0to2019-08-04 08:00:00.0
Location: 北京海淀区
Host:北京市计算中心
10x Genomics单细胞转录组测序及多组学数据挖掘技术培训班
转录组学数据泛滥的时代,如何才能找到数据中的亮点,如何深度挖掘数据中隐藏的创新点,让科研工作者掌握几种深度解析组学数据的方法。本课程一共3天,全部课程均理论与实战结合。从Linux和R基础、分析平台搭建、SCI论文图表整理、多组学分析思路、常规转录组及单细胞转录组分析标准流程、差异基因分析、功能富集分析、流程优化。主讲专家来自重点高校及科研院所一线科研人员,长期从事生物数据分析与挖掘,基因测序等领域工作研究工作,以第一作者发表过多篇生物学一区、二区TOP SCI论文(如:Plos Genetics; Plant Cell等)。精通python语言、R语言等分析工具,具有丰富的科研及高通量测序数据分析与挖掘经验,培训学员近2000人。
主办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
工信部和信息化人才培养工程培训基地
中国生物工程杂志
举 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
课程安排:
2019年8月2-4日
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主题 |
简介 |
第一天 (理论+实操) |
10X Genomics 单细胞转录组测序技术、单细胞悬浮液或原生质体制备技术
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1、 基因组、生物信息学相关的背景概述 2、10X Genomics 单细胞转录组测序技术简介 3、单细胞悬浮液或原生质体制备技术 4、上机操作基础(R语言实操、Linux服务器架构及基本操作) |
第二天(理论+实操) |
单细胞转录组测序技术分析流程(常规分析及高级分析流程介绍及深度解析)
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1、 Cell ranger 质控 2、 T-SNE聚类 3、 如何确定细胞类群 4、如何寻找bio-marker 5、如何优化分析流程 |
第三天 (理论+实操) |
多组学数据深度挖掘、结果展示技巧及高分SCI论文整理思路
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1、多组学研究思路 2、 多种作图方式结合 (综合利用R、PPT等绘图工具拼接完成论文图片) 3、高分辨率SCI论文图片生成 n (综合利用AI、pdfviewer生成高质量论文图片) n 数据重复性评估 (如何在文中体现出不同重复的RNA-SEQ结果、Realtime PCR结果与RNA-SEQ结果如何对用) n 基因共表达网络构建与Cytoscape展示 n 多组数据表达趋势聚类及深度解析策略 |
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【收费标准】 注册费:3900元/人,包括学费、资料费、上机费、午餐费。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。培训期间可免费提供工作餐。
【报名优惠政策】
1、 7.15日前报名并缴费的学员每人可减少200元
2、 3人以上团体报名每人可减少300元;
3、 4+1团报,可免费赠送一个名额;
4、 上面几种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
老学员参加及老学员推荐参加均可额外优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
【请联系】QQ号:2814500767邮箱:bcc-sxpx@bcc.ac.cn
徐老师 010-59341786,15801436028(微信同号)
员老师 010-59341773,18701529461(微信同号)
【付费方式】 现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账 号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(备注:在汇款明细里加上“生物计算事业部——您的姓名”)
【注】开课前一周会发送邮件通知,若未接到邮件通知,请电话咨询
会议时间 | 2019-08-02至2019-08-04 |
会议地点 | 北京海淀区 |
主办单位 | 北京市计算中心 |
联系人 | 员老师 |
电话 | 18701529461 |
yuanll@bcc.ac.cn |
声明:
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