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孟庆刚,朱士恩,曾申明,张忠诚
《中国工程科学》 2001年 第3卷 第11期 页码 65-69
论述了一种新的小鼠卵母细胞去核方法一一表面张力辅助去核法(STA),并同时与其他3种去核方 法(简称A法、B法、C法)进行比较。经STA法去核的卵母细胞质体用于电融合介导的小鼠耳成纤维细胞核移植实验,结果有 76.1 %细胞与细胞质体融合形成重组胚,85.4 %的重组胚形成原核,49.4%卵裂形成2-细胞。
王蔚芳,李青梅,柴书军,甘玲玲,洪磊,郭军庆,雷霁霖
《中国工程科学》 2014年 第16卷 第9期 页码 16-20
脂肪变性诱发肝癌发生机制——HCV核心基因转基因小鼠的经验教训 Review
Pan Diao, Fangping Jia, Xiaojing Wang, Xiao Hu, Takefumi Kimura, Takero Nakajima, Toshifumi Aoyama, Kyoji Moriya, Kazuhiko Koike, Naoki Tanaka
《工程(英文)》 2021年 第7卷 第12期 页码 1797-1805 doi: 10.1016/j.eng.2021.08.019
功能代谢组学揭示黄芪多糖通过2-羟基丁酸改善肥胖小鼠的脂质代谢 Article
李冰冰, 洪颖, 顾彧, 叶圣洁, 胡凯莉, 姚建, 丁侃, 赵爱华, 贾伟, 李后开
《工程(英文)》 2022年 第9卷 第2期 页码 111-122 doi: 10.1016/j.eng.2020.05.023
片仔癀通过调节小鼠的肠道菌群和代谢物抑制非酒精性脂肪性肝炎 Article
曾宪一, 张翔, 苏浩, 苟红艳, 刘焯晞, 胡晓旭, 黄子恒, 李艳, 于君
《工程(英文)》 2024年 第35卷 第4期 页码 257-269 doi: 10.1016/j.eng.2022.10.010
肠道菌群调控的色氨酸代谢改善了D-Gal/LPS诱导的C57BL/6小鼠急性肝衰竭 Article
郑志鹏, 伍莉, 韩玉秋, 陈俊, 朱帅, 姚圆圆, 王保红, 李兰娟
《工程(英文)》 2022年 第14卷 第7期 页码 134-146 doi: 10.1016/j.eng.2020.12.013
基于人工智能的肺癌NOG/PDX模型驱动基因匹配预测 Article
何雅億, 郭皓越, 刁丽, 陈宇, 朱俊杰, Hiran C. Fernando, Diego Gonzalez Rivas, 祁辉, Chunlei Dai, 汤旭蓁, 朱军, 戴家威, 何侃, Dan Chan, 杨洋
《工程(英文)》 2022年 第15卷 第8期 页码 102-114 doi: 10.1016/j.eng.2021.06.017
患者源性肿瘤异种移植物(PDX)是癌症药物发现和筛查的有力工具。然而,目前的研究对PDX的基因型错配知之甚少,导致PDX使用过程中产生巨大的经济损失。在此,本研究建立了53 例肺癌患者的PDX模型,基因型匹配率为79.2%(42/53)。此外,检查了17 个临床病理学特征,并基于最低赤池信息量准则(AIC)、最小绝对收缩和选择算子(LASSO)-逻辑回归(LR)、支持向量机(SVM)递归特征消除(SVM-RFE)、极端梯度增强(XGBoost)、梯度增强和分类特征(CatBoost),以及合成少数过采样技术(SMOTE)输入逐步逻辑回归模型。最后,通过100 个试验组的准确度、受试者工作特征曲线下面积(AUC)和F1 评分评价所有模型的性能。两个多变量 LR 模型显示,年龄、驱动基因突变的数量、表皮生长因子受体(EGFR)基因突变、既往化疗的类型、既往酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗和样本来源是强有力的预测因素。此外,CatBoost (平均精度= 0.960;平均AUC = 0.939;平均F1 分数= 0.908)和八特征SVM-RFE(平均精度= 0.950;平均AUC = 0.934;平均F1 分数= 0.903)在算法中表现出最好的性能。同时,除CatBoost 外,SMOTE的应用提高了大多数模型的预测能力。基于SMOTE,单一模型的集成分类器达到了最高的准确度(平均值= 0.975)、AUC(平均值= 0.949)和F1 评分(平均值= 0.938)。总之,本文建立了一个最佳预测模型来筛选肺癌患者的NOD/Shi-scid白细胞介素-2受体(IL-2R) γnull(NOG)/PDX模型,并为建立预测模型提供了一种通用方法。
关键词: 机器学习 患者源性肿瘤异种移植物 NOG小鼠
作为一种新的心肌细胞代谢改变和焦亡调节剂,CPAL可调节小鼠心肌梗死损伤 Article
李佳敏, 薛宏儒, 徐宁, 龚丽玲, 李鸣, 李思佳, 黄迪, 张庆伟, 李鹏宇, 李青穗, 于航, 刘伊宁, 薛亚东, 陈海鑫, 刘佳丽, 张万玉, 刘明彬, 常思雨, 郎宪治, 赵星淼, 杜伟杰, 蔡本志, 王宁, 杨宝峰
《工程(英文)》 2023年 第20卷 第1期 页码 49-62 doi: 10.1016/j.eng.2022.08.012
标题 作者 时间 类型 操作
脂肪变性诱发肝癌发生机制——HCV核心基因转基因小鼠的经验教训
Pan Diao, Fangping Jia, Xiaojing Wang, Xiao Hu, Takefumi Kimura, Takero Nakajima, Toshifumi Aoyama, Kyoji Moriya, Kazuhiko Koike, Naoki Tanaka
期刊论文
基于人工智能的肺癌NOG/PDX模型驱动基因匹配预测
何雅億, 郭皓越, 刁丽, 陈宇, 朱俊杰, Hiran C. Fernando, Diego Gonzalez Rivas, 祁辉, Chunlei Dai, 汤旭蓁, 朱军, 戴家威, 何侃, Dan Chan, 杨洋
期刊论文