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越南广平和顺化两省猪场分离副猪嗜血杆菌的抗生素耐药表型和耐药基因之间的相关性研究 Article
Chao Nguyen Van, 张丽君, Tam Vu Thi Thanh, Hung Pham Hoang Son, Tuan Tran Ngoc, 黄琦, 周锐
《工程（英文）》 2020年 第6卷 第1期 页码 40-48 doi: 10.1016/j.eng.2019.10.014
关键词： 副猪嗜血杆菌，抗药性，耐药基因，越南
细菌耐药性威胁人类健康 Editorial
沈建忠, Timothy R. Walsh
《工程（英文）》 2022年 第15卷 第8期 页码 1-2 doi: 10.1016/j.eng.2022.06.003
微生物耐药性在人与动物间的传播——我们为什么需要知道更多？ Views & Comments
Julian Parkhill
《工程（英文）》 2022年 第15卷 第8期 页码 11-12 doi: 10.1016/j.eng.2022.04.007
基于同一健康策略探究老挝人、动物和环境中多黏菌素耐药性的传播特征 Article
周宇晴, Refath Farzana, Somsavanh Sihalath, Sayaphet Rattanavong, Manivanh Vongsouvath, Mayfong Mayxay, Kirsty Sands, Paul N. Newton, David A.B. Dance, Brekhna Hassan, Timothy R. Walsh
《工程（英文）》 2022年 第15卷 第8期 页码 45-56 doi: 10.1016/j.eng.2022.01.013
This study was designed to investigate the molecular epidemiology of mobile colistin resistance (mcr) using a "One-Health" approach in Laos and to predict whether any dominant plasmid backbone and/or strain type influences the dissemination of mcr. We collected 673 samples from humans (rectal normal flora), poultry, and the environment (water, flies, birds, etc.) in Vientiane, Lao People's Democratic Republic (Laos), from May to September 2018. A total of 238 Escherichia coli (E. coli) isolated from nonduplicative samples, consisting of 98 MCR-positive E. coli (MCRPEC) ("mcr" denotes the gene encoding mobile colistin resistance, and "MCR" denotes the subsequent protein encoded by mcr) and 140 MCRnegative E. coli (MCRNEC), were characterized by phenotype and Illumina sequencing. A subset of MCRPEC was selected for MinION sequencing, conjugation assay, plasmid stability, and growth kinetics in vitro. The prevalence of MCRPEC was found to be 14.6% (98/673), with the highest prevalence in human rectal swabs (45.9% (45/98), p < 0.0001, odds ratio (OR): 0.125, 95% confidence interval (CI): 0.077–0.202). The percentages of MCRPEC from other samples were 14.3% (2/14) in dog feces, 12.0% (24/200) in flies, 11.0% (11/100) in chicken meat, 8.9% (8/90) in chicken cloacal, 8.0% (4/50) in chicken caeca, and 7.5% (4/53) in wastewater. MCRPEC was significantly more resistant to co-amoxiclav, sulfamethoxazoletrimethoprim, levofloxacin, ciprofloxacin, and gentamicin than MCRNEC (p < 0.05). Genomic analysis revealed the distribution of MCRPEC among diverse clonal types. The putative plasmid Inc types associated with mcr-1 were IncX4, IncHI2, IncP1, IncI2, and IncFIA, and those associated with mcr-3 were IncFII, IncFIA, IncFIB, IncP1, and IncR. Recovery of highly similar plasmids from both flies and other sampling sectors implied the role of flies in the dissemination of mcr-1. mcr-positive plasmids were shown to be conjugative, and a significantly high transfer rate into a hypervirulent clone ST1193 was observed. Plasmids containing mcr irrespective of Inc type were highly stable and invariably did not exert a fitness effect upon introduction into a new host. These findings signify the urgent need for a standard infection control program to radically decontaminate the source of resistance.
2014—2016年食品动物源RE-cmeABC阳性弯曲菌流行与耐药性现状 Article
刘德俊, 刘蔚雯, 李星, 姚红, 沈张奇, 汪洋, 沈建忠
《工程（英文）》 2020年 第6卷 第1期 页码 34-39 doi: 10.1016/j.eng.2019.10.013
关键词： RE- cmeABC 弯曲菌 环丙沙星 氟苯尼考
头孢他啶-阿维巴坦耐药革兰氏阴性菌的流行病学特征及耐药机制 Review
徐婷婷, 郭育奇, 姬扬, 王保红, 周凯
《工程（英文）》 2022年 第11卷 第4期 页码 138-145 doi: 10.1016/j.eng.2020.11.004
细菌的碳青霉烯耐药性是全球公共健康面临的一个重大挑战，由碳青霉烯耐药菌（CRO）引起的临床感染通常有很高的发病率和死亡率。然而，这种药物在临床使用后不久，细菌的耐药性就已经出现，并且呈上升趋势。了解细菌对CAZ-AVI 的耐药机制，对于指导开发新型治疗方法、帮助预测潜在的耐药机制至关重要。短时间内多种CAZ-AVI耐药机制的产生，强调了临床合理用药的重要性以及监测CAZ-AVI 耐药性病原体的必要性。
猪链球菌中发现可介导链阳菌素A、截短侧耳素类以及林可酰胺类药物耐药的新型耐药基因 srpA Article
张朝阳, 刘璐, 张朋, 崔箐坡, 秦晓霞, 马立超, 韩坤, 王战辉, 王少林, 丁双阳, 沈张奇
《工程（英文）》 2022年 第9卷 第2期 页码 85-94 doi: 10.1016/j.eng.2020.12.015
细菌耐药性问题毫无疑问是全球最大的健康威胁之一。耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌、耐万古霉素的屎肠球菌和耐β-内酰胺的肺炎链球菌等多重耐药革兰氏阳性菌的出现，严重限制了临床可用的抗菌药物。功能克隆试验显示该基因可以介导猪链球菌和金黄色葡萄球菌等对截短侧耳素类、林可酰胺类和链阳菌素A类抗菌药物的交叉耐药性。进一步研究发现SrpA 中loop 区的氨基酸突变或缺失将不同程度地影响细菌的耐药性，证实该结构域对SrpA 功能至关重要。
2018—2019年我国北方地区奶牛临床型乳房炎源肺炎克雷伯菌的分子特征 Article
宋士凯, 何文娟, 杨大伟, Manar Benmouffok, 王瑶, 李基云, 孙城涛, 宋祥彬, 马士珍, 蔡畅, 丁双阳, 吴聪明, 沈张奇, 汪洋
《工程（英文）》 2022年 第10卷 第3期 页码 146-154 doi: 10.1016/j.eng.2021.01.015
肺炎克雷伯菌是奶牛乳房炎的重要诱因，常引起奶牛的产奶量降低和死亡率增高。目前尚缺乏奶牛乳房炎源肺炎克雷伯菌分子特征的研究数据，限制了对其在食品生产链中传播风险的评估。本研究于2018—2019 年从我国北方地区患临床型乳房炎奶牛中采集了6301 份奶样，共分离到183 株肺炎克雷伯菌，两年的平均分离率分别为3.03%和2.80%。与人类临床肺炎克雷伯菌分离株相似，奶牛临床型乳房炎源肺炎克雷伯菌分离株可分为肺炎克雷伯菌(KpI，143 株）、准肺炎克雷伯菌（KpII-B，37 株）和变栖肺炎克雷伯菌（KpIII，3 株）三个种群。在KpI 分离株中检测到超广谱β-内酰胺酶（ESBL）的编码基因blaSHV-2a、blaCTX-M-14和blaCTX-M-15，以及可能与奶牛致病性和宿主适应性有关的编码基因clpC、lpfA、lacI、lacZ、lacY和fecABDEIR。KpI 菌株比KpII-B 和KpIII 菌株表现出更高的流行率以及抗生素耐药基因和毒力基因携带率，表明它可能对奶牛的危害更大。此外，还发现奶牛KpI菌株与人医临床分离的KpI菌株在种群结构上存在明显差异，且奶牛源KpI菌株中很少见到与人类侵袭性感染相关的基因，表明奶牛源KpI菌株对人类健康的威胁较小；奶牛KpII-B 分离株与人类感染分离株具有较高的核苷酸序列一致性，且它们携带固氮基因nif的比例都很高，表明奶牛和人类KpII-B 分离株与植物源性KpII-B 菌株之间存在一定关联。
应对可转移多黏菌素耐药性——饲料添加剂来源的白屈菜红碱具有双重效应 Article
宋黄威, 王雪杨, 张慕琛, 邹之宇, 杨思源, 易甜, 王建峰, 刘德俊, 沈应博, 代重山, 刘志海, Timothy R. Walsh, 沈建忠, 吴聪明, 汪洋
《工程（英文）》 2024年 第32卷 第1期 页码 163-173 doi: 10.1016/j.eng.2023.06.012
可转移多黏菌素耐药基因mcr-1及其变异体的出现、蔓延严重威胁了多黏菌素作为临床治疗多重耐药革兰阴性菌感染最后一道防线药物的药效。寻找抗生素佐剂是恢复多黏菌素对其耐药菌敏感性的有效策略。然而，鲜有研究探索抗生素佐剂对多黏菌素耐药基因传播的影响。本研究发现，来源于饲料添加剂博落回散中的白屈菜红碱（4 mg∙L−1）在体外抑菌试验能使多黏菌素对mcr-1阳性大肠杆菌的MIC降低16倍（由 2 至 0.125 mg∙L−1），且在肠道感染模型中与对照组相比，能降低104左右的mcr-1阳性大肠杆菌菌载量。同时，白屈菜红碱在体外试验中能降低mcr-1阳性质粒的接合转移频率（超过100倍），且在体内肠道接合转移模型中能显著降低该质粒的接合转移频率（5倍）。机制研究发现，白屈菜红碱通过靶向细菌细胞膜上的磷脂成分，增大细胞膜的流动性，抑制了细菌呼吸作用，扰乱质子动势（proton motive force, PMF），产生活性氧（reactive oxygen species, ROS），造成细菌胞内ATP耗竭，下调了mcr-1及接合转移相关基因的转录水平，从而实现既能增强多黏菌素对抗耐药菌作用，又能抑制耐药质粒接合转移的双重作用。白屈菜红碱的双重作用拓展了抗生素佐剂的应用范围，并提供了应对多黏菌素耐药的新思路。
碳青霉烯类耐药性在人源和动物源产NDM酶大肠埃希菌间的传播 Article
沈应博, 胡付品, 王永强, 尹丹丹, 杨璐, 陈义强, 许春燕, 李基云, 蒋君瑶, 王雪杨, 付玉林, 邵东延, 刘德俊, 马藤菲, 蔡畅, 沈张奇, 王少林, 李娟, 张嵘, 柯跃斌, 吴聪明, 沈建忠, Timothy R. Walsh, 汪洋
《工程（英文）》 2022年 第15卷 第8期 页码 24-33 doi: 10.1016/j.eng.2021.07.030
Although carbapenem use is prohibited in animals in China, carbapenem-resistant Escherichia coli (CREC), especially New Delhi metallo-β-lactamase (NDM)-producing strains, are widely prevalent in foodproducing animals. At present, the impact of livestock-associated CREC strains on human populations at the national level is unknown. Here, we conduct a retrospective cross-sectional study to investigate the prevalence of CREC from clinical settings across 22 Chinese provinces or municipalities and analyze anthropogenic factors associated with their presence. We also ascertain the blaNDM and blaKPC abundance among pig and chicken farms and present a detailed genomic framework for CREC of animal and human origin. Overall, 631/29799 (2.1%) clinical Escherichia coli (E. coli) isolates were identified as CREC. Multivariable analysis revealed that being male, an age below 1, an age between 13 and 18, provinces with greater chicken production, and provinces with higher pig production were associated with higher odds of CREC infection. In general, 73.8% (n = 45/61) of pig farms and 62.2% (n = 28/45) of chicken farms had a blaNDM abundance of 1×10－5 to 1×10－3 and 1×10－3 to 1×10－2, respectively. Among all the Chinese NDM-positive E. coli (n = 463) available at the National Center for Biotechnology Information (NCBI), the genomic analysis revealed that blaNDM-5 and IncX3 were the predominant carbapenemase gene-plasmid combination, while a highly homogeneous relationship between NDM-positive isolates from humans and animals was demonstrated at the plasmid and core genome levels. All the findings suggest frequent CREC transmission between humans and animals, indicating that further discussions on the use of antibiotics in animals and humans are needed, both in China and across the globe.
关键词： Carbapenem resistance Escherichia coli blaNDM-5 One Health Antimicrobial resistance transmission
标题 作者 时间 类型 操作
越南广平和顺化两省猪场分离副猪嗜血杆菌的抗生素耐药表型和耐药基因之间的相关性研究
Chao Nguyen Van, 张丽君, Tam Vu Thi Thanh, Hung Pham Hoang Son, Tuan Tran Ngoc, 黄琦, 周锐
期刊论文
基于同一健康策略探究老挝人、动物和环境中多黏菌素耐药性的传播特征
周宇晴, Refath Farzana, Somsavanh Sihalath, Sayaphet Rattanavong, Manivanh Vongsouvath, Mayfong Mayxay, Kirsty Sands, Paul N. Newton, David A.B. Dance, Brekhna Hassan, Timothy R. Walsh
期刊论文
猪链球菌中发现可介导链阳菌素A、截短侧耳素类以及林可酰胺类药物耐药的新型耐药基因 srpA
张朝阳, 刘璐, 张朋, 崔箐坡, 秦晓霞, 马立超, 韩坤, 王战辉, 王少林, 丁双阳, 沈张奇
期刊论文
2018—2019年我国北方地区奶牛临床型乳房炎源肺炎克雷伯菌的分子特征
宋士凯, 何文娟, 杨大伟, Manar Benmouffok, 王瑶, 李基云, 孙城涛, 宋祥彬, 马士珍, 蔡畅, 丁双阳, 吴聪明, 沈张奇, 汪洋
期刊论文
应对可转移多黏菌素耐药性——饲料添加剂来源的白屈菜红碱具有双重效应
宋黄威, 王雪杨, 张慕琛, 邹之宇, 杨思源, 易甜, 王建峰, 刘德俊, 沈应博, 代重山, 刘志海, Timothy R. Walsh, 沈建忠, 吴聪明, 汪洋
期刊论文
京公网安备 11010502051620号
