检索范围：
排序： 展示方式：
低蛋白日粮中添加亮氨酸通过雷帕霉素靶蛋白信号通路增加成年大鼠骨骼肌重量及蛋白质合成
张博, 楚丽翠, 刘宏, 谢春元, 谯仕彦, 曾祥芳
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第5期 页码 760-765 doi: 10.1016/J.ENG.2017.03.008
低蛋白日粮会减少动物组织中蛋白质沉积，影响骨骼肌增重。本文旨在研究低蛋白日粮中添加亮氨酸对成年大鼠骨骼肌重量和蛋白质合成的影响。试验第11天，所有大鼠大剂量一次性腹腔注射L-[ring-2H5]苯丙氨酸注射液，测定血清中的氨基酸含量、比目鱼肌和腓肠肌重量、蛋白质合成速率及mTOR信号通路相关分子的表达。结果表明，在3个处理中，RL组血清亮氨酸含量最高（P < 0.05），而异亮氨酸含量最低（P < 0.05）；CON组的缬氨酸含量低于R和RL组（P < 0.05），但采食量、蛋白质合成速度和与R组相比，RL组可以增加腓肠肌重量（P < 0.05），促进S6K1磷酸化（P < 0.05），增加骨骼肌蛋白质合成（P < 0.05）。本文结论如下，在成年大鼠长期采食低蛋白日粮的情况下，日粮中添加亮氨酸可以改善大鼠的生长性能，通过提高mTOR通路中S6K1磷酸化水平，促进大鼠骨骼肌蛋白质合成，抑制蛋白质降解。
时间序列多组学整合分析揭示原代肝细胞体外培养去分化过程伴随非降解性泛素化修饰的增加 Article
姜正一, 孙泽宇, 欧阳晓希, 赵亚磊, 周梦豪, 王保红, 李启睿, 范林骁, 张赛男, 李兰娟
《工程（英文）》 2020年 第6卷 第11期 页码 1302-1314 doi: 10.1016/j.eng.2020.02.011
人类蛋白质N-糖基化的十二年全基因组关联研究 Review
Anna Timoshchuk, Sodbo Sharapov, Yurii S. Aulchenko
《工程（英文）》 2023年 第26卷 第7期 页码 17-31 doi: 10.1016/j.eng.2023.03.013
Most human-secreted and membrane-bound proteins have covalently attached oligosaccharide chains, or glycans. Glycosylation influences the physical and chemical properties of proteins, as well as their biological functions. Unsurprisingly, alterations in protein glycosylation have been implicated in a growing number of human diseases, and glycans are increasingly being considered as potential therapeutic targets, an essential part of therapeutics, and biomarkers. Although glycosylation pathways are biochemically well-studied, little is known about the networks of genes that guide the cell- and tissue-specific regulation of these biochemical reactions in humans in vivo. The lack of a detailed understanding of the mechanisms regulating glycome variation and linking the glycome to human health and disease is slowing progress in clinical applications of human glycobiology. Two of the tools that can provide much sought-after knowledge of human in vivo glycobiology are human genetics and genomics, which offer a powerful data-driven agnostic approach for dissecting the biology of complex traits. This review summarizes the current state of human populational glycogenomics. In Section 1, we provide a brief overview of the N-glycan's structural organization, and in Section 2, we give a description of the major blood plasma glycoproteins. Next, in Section 3, we summarize, systemize, and generalize the results from current N-glycosylation genome-wide association studies (GWASs) that provide novel knowledge of the genetic regulation of the populational variation of glycosylation. Until now, such studies have been limited to an analysis of the human blood plasma N-glycome and the N-glycosylation of immunoglobulin G and transferrin. While these three glycomes make up a rather limited set compared with the enormous multitude of glycomes of different tissues and glycoproteins, the study of these three does allow for powerful analysis and generalization. Finally, in Section 4, we turn to genes in the established loci, paying particular attention to genes with strong support in Section 5. At the end of the review, in Sections 6 and 7, we describe special cases of interest in light of new discoveries, focusing on possible mechanisms of action and biological targets of genetic variation that have been implicated in human protein N-glycosylation.
转录因子HNF1A、HNF4A和FOXA2调节肝细胞蛋白质N-糖基化 Article
Vedrana Vičić Bočkor,Nika Foglar,Goran Josipović,Marija Klasić,Ana Vujić,Branimir Plavša,Toma Keser,Samira Smajlović,Aleksandar Vojta,Vlatka Zoldoš
《工程（英文）》 2024年 第32卷 第1期 页码 58-69 doi: 10.1016/j.eng.2023.09.019
Hepatocyte nuclear factor 1 alpha (HNF1A), hepatocyte nuclear factor 4 alpha (HNF4A), and forkhead box protein A2 (FOXA2) are key transcription factors that regulate a complex gene network in the liver, creating a regulatory transcriptional loop. The Encode and ChIP-Atlas databases identify the recognition sites of these transcription factors in many glycosyltransferase genes. Our in silico analysis of HNF1A, HNF4A, and FOXA2 binding to the 10 candidate glyco-genes studied in this work confirms a significant enrichment of these transcription factors specifically in the liver. Our previous studies identified HNF1A as a master regulator of fucosylation, glycan branching, and galactosylation of plasma glycoproteins. Here, we aimed to functionally validate the role of the three transcription factors on downstream glyco-gene transcriptional expression and the possible effect on glycan phenotype. We used the state-of-the-art clustered regularly interspaced short palindromic repeats/dead Cas9 (CRISPR/dCas9) molecular tool for the downregulation of the HNF1A, HNF4A, and FOXA2 genes in HepG2 cells—a human liver cancer cell line. The results show that the downregulation of all three genes individually and in pairs affects the transcriptional activity of many glyco-genes, although downregulation of glyco-genes was not always followed by an unambiguous change in the corresponding glycan structures. The effect is better seen as an overall change in the total HepG2 N-glycome, primarily due to the extension of biantennary glycans. We propose an alternative way to evaluate the N-glycome composition via estimating the overall complexity of the glycome by quantifying the number of monomers in each glycan structure. We also propose a model showing feedback loops with the mutual activation of HNF1A–FOXA2 and HNF4A–FOXA2 affecting glyco-genes and protein glycosylation in HepG2 cells.
关键词： Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/dead Cas9 (CRISPR/dCas9) Epigenetics Hepatocyte nuclear factor 1 alpha (HNF1A) Hepatocyte nuclear factor 4 alpha (HNF4A) Forkhead box protein A2 (FOXA2) N-glycosylation HepG2 cells
普列克底物蛋白同源物样结构域家族A成员1蛋白——导致代谢疾病的多方面细胞存活因素 Review
Tamana Yousof, Jae Hyun Byun, Jack Chen, Richard C. Austin
《工程（英文）》 2023年 第20卷 第1期 页码 9-18 doi: 10.1016/j.eng.2022.05.014
普列克底物蛋白同源物样结构域家族A成员1（PHLDA1）是多作用的胞内蛋白，属于进化上保守的普列克底物蛋白同源相关结构域家族。最初，PHLDA1的小鼠同源基因——T 细胞死亡相关51 基因（TDAG51）——因其在T细胞杂交瘤中活化诱导的细胞凋亡中的作用而被发现越来越多的证据也证实，PHLDA1在内质网应激信号通路中作为细胞凋亡、自噬和增殖的关键介质发挥作用。本文综述了PHLDA1基因及蛋白调控、定位和功能方面的现有知识。
王叶青,吴勤明,孟祥举,肖丰收
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第4期 页码 567-574 doi: 10.1016/J.ENG.2017.03.029
作为当前最重要的工业催化材料之一，沸石分子筛的合成一般是在有机模板存在的条件下水热合成的，但是该合成过程会产生大量的有害气体和废水，不仅污染环境，还增加了生产成本。本文旨在概述有机模板在沸石分子筛合成过程中的角色，并据此分别设计沸石晶种和导向剂溶液导向的无有机模板条件下合成沸石分子筛的路线。在此基础上，总结并揭示了在无有机模板的Na+ 体系中合成的沸石分子筛的微孔体积与Si/Al 比值的关系，即微孔体积越大，Si/Al 比值越小，这对于无有机模板条件下合成Si/Al 比值可调控的沸石分子筛和设计它们的合成路线具有重要意义
曹 晨,余 波,顾为东
《中国工程科学》 2015年 第17卷 第3期 页码 107-112
早期监测肝细胞癌的新型非蛋白生物标志物 Review
Ghassan K. Abou-Alfa, 吴琳, Augusto Villanueva
《工程（英文）》 2021年 第7卷 第10期 页码 1369-1374 doi: 10.1016/j.eng.2021.02.020
基于液滴微流控的分级结构反蛋白石多孔支架用于仿生三维细胞共培养 Article
邵长敏, 刘羽霄, 池俊杰, 叶方富, 赵远锦
《工程（英文）》 2021年 第7卷 第12期 页码 1778-1785 doi: 10.1016/j.eng.2020.06.031
三维（3D）细胞培养具有更好地模拟天然组织特异性的优势，在药物开发、毒性测试和组织工程中发挥着重要作用。然而，现有的3D细胞培养的支架或微载体通常尺寸有限，并且在模拟生物体内血管复合体方面表现不佳。因此，本研究提出了一种通过简单的微流控方法制备的新型分级结构反蛋白石多孔支架，用于促进3D细胞共培养。研究结果表明，该支架能够保证细胞培养过程中的营养供给，从而实现大面积的细胞培养。此外，通过在该支架中连续种植不同的细胞，本文还开发了内皮细胞包裹肝细胞的3D细胞共培养系统，用于构建功能化组织。研究结果表明，该支架用于细胞共培养系统，有助于维持肝细胞特定的体内功能。该分级结构反蛋白石多孔支架为3D细胞培养甚至仿生组织的构建奠定了基础。
假单胞菌环状脂肽Medpeptin的生物合成及其调控植物免疫的作用机制 Article
谷医林, 李俊州, 李彦, 从珅, 王静, 马毅楠, 魏海雷
《工程（英文）》 2023年 第28卷 第9期 页码 153-165 doi: 10.1016/j.eng.2023.05.016
关键词： 假单胞菌 环状脂肽 细胞死亡 富含异亮氨酸的延伸蛋白 类受体激酶
工业5.0——仿生学和合成生物学的关联及内涵 Artical
Peter Sachsenmeier
《工程（英文）》 2016年 第2卷 第2期 页码 225-229 doi: 10.1016/J.ENG.2016.02.015
关键词： 仿生学 合成生物学 生物工程 生物传感器 生物燃料 生物武器 虚拟进化 原始细胞 异种细胞 经济意义 工业5.0 德国 中国
基于表位定向细胞库筛选高亲和力PD-1突变体诱骗分子 Article
刘昊, 乔春霞, 胡乃静, 王志宏, 王晶, 冯健男, 沈倍奋, 马远方, 罗龙龙
《工程（英文）》 2021年 第7卷 第11期 页码 1557-1565 doi: 10.1016/j.eng.2020.11.011
抗程序性细胞死亡蛋白-1（programmed cell death protein-1,PD-1）/程序性细胞死亡配体-1（programmed cell death ligand-1, PD-L1）单克隆抗体的免疫疗法已成为治疗肺癌、肠癌和黑色素瘤等多种癌症的常规方法。通过对PD-1及其配体（即PD-L1和PD-L2）或抗体Opdivo的理论结合分析，建立了PD-1的一个小库容量、表位定向的哺乳动物细胞文库。经过三轮细胞分选，筛选出对PD-L1有较高亲和力的PD-1突变体463（亲和力较野生型PD-1提高近3个数量级）。在MC38转基因小鼠模型中，463可有效逆转PD-1对T细胞活化的抑制作用，而且10 mg·kg−1的463突变体蛋白对肿瘤生长的抑制率约为75%，与同等剂量下
标题 作者 时间 类型 操作
转录因子HNF1A、HNF4A和FOXA2调节肝细胞蛋白质N-糖基化
Vedrana Vičić Bočkor,Nika Foglar,Goran Josipović,Marija Klasić,Ana Vujić,Branimir Plavša,Toma Keser,Samira Smajlović,Aleksandar Vojta,Vlatka Zoldoš
期刊论文
普列克底物蛋白同源物样结构域家族A成员1蛋白——导致代谢疾病的多方面细胞存活因素
Tamana Yousof, Jae Hyun Byun, Jack Chen, Richard C. Austin
期刊论文
京公网安备 11010502051620号
