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王保红, 姚铭飞, 吕龙贤, 凌宗欣, 李兰娟
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 71-82 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.008
数以万亿计的微生物寄生于人体表面和体内，并与人类起演变多种环境因素可影响胃肠道微生的平衡，这些改变与人体健康和疾病密切相关本文重点关注人体微生与宿主之间的相互作用，总体概括微生物在人体基本生命过程中以及主要疾病中起的作用，如感染性疾病肝脏疾病胃肠道肿瘤、代谢疾病呼吸系统疾病精神或心理疾病和自身免疫疾病等。我们还综述了微生物研究相关术的重要进展，如DNA 测序、代谢组学和基于计算生物信息学的蛋白质组学目前对人类微生态的研究已经更加复杂和全面建议研究应更多关注–宿主微生物的相互作用和因果关系，这有助于我们更好地了解肠道微生物在人类健康和疾病中的作用
Marc Mac Giolla Eain, Joanna Baginska, Kacy Greenhalgh, Joëlle V. Fritz, Frederic Zenhausern, Paul Wilmes
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 60-65 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.011
研究宿主–胃肠道微生物的相互作用已经成为管理人类健康和疾病的关键组成部分。微生理系统的发展正在为研究人员提供前所未有的对于这种复杂关系的获取和理解。这些系统结合了微型工程、微流体和细胞培养的优点，来创建人类肠道中普遍存在的环境条件。在这里我们提出的HuMiX(人类微生物交联对话) 平台，是一个利用这种多学科方法提供具有代表性的人体胃肠道的体外模型系统，用于研究宿主–微生物分子的相互作用。
高能聚焦超声热治疗恶性肿瘤的初步探索——附78例治疗临床应用报告
何申戌,熊六林,于晋生,兰江
《中国工程科学》 1999年 第1卷 第2期 页码 62-66
肝硬化患者胃黏膜微生物菌群特征及其与胃肠道症状的相关性分析 Article
陈燕飞, 郭静, 陈春雷, 石鼎, 方戴琼, 季峰, 李兰娟
《工程（英文）》 2021年 第7卷 第4期 页码 507-514 doi: 10.1016/j.eng.2020.04.014
研究表明，肝硬化患者的口腔和肠道微生物群与健康人群存在差异。胃位于口腔和肠道之间，关于其黏膜微生物群结构所知甚少。胃黏膜菌群结构表现为聚类2的患者胃肠道症状更严重，既往内镜下曲张静脉的治疗率显著高于其他组。我们的研究结果表明，在肝硬化中，幽门螺杆菌和非幽门螺杆菌的定植都受到影响。既往内镜下静脉曲张治疗会引起胃黏膜菌群结构明显改变，从而加重幽门螺杆菌阴性肝硬化患者的胃肠道症状。
吕桂帅, 程宁涛, 王红阳
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 110-114 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.017
一个多世纪以前，科学家们就首次发现了肿瘤区域中细菌的存在。但是，微生物在肿瘤发生中的作用近年来才被认识到。近几十年来，与肠道菌群失调相关的疾病代表了全世界最严重的一些公共卫生问题。大量的流行病学研究表明，肠道菌群与某些常见肿瘤密切相关。然而，肠道菌群与肿瘤相关联的具体分子机制仍不明确。研究表明，肠道菌群的改变有助于确定肝癌、酒精相关肝病、非酒精性脂肪肝和肝硬化的发生和发展。本文总结了肠道菌群在肿瘤及肝病中的研究进展，综述了肠道菌群与肿瘤和肝病之间的关系。此外，考虑到细菌内稳态的重要性，我们也对益生菌进行了概述，旨在为相关疾病的治疗提供指导。
外泌体CD44与整合素α6β4结合激活宿主细胞重塑肿瘤微环境促进胰腺癌恶性转移 Article
牟为, 许亚婕, 顾鹏飞, 王文斌, 李井泉, 葛阳, 王慧
《工程（英文）》 2021年 第7卷 第10期 页码 1415-1425 doi: 10.1016/j.eng.2020.08.013
肿瘤特异性环状RNA来源抗原肽被证实存在于肝胆肿瘤中 Article
王文闻, 马莉丽 , 邢政, 苑廷淦, 包金霞, 朱妍静, 赵晓芳, 赵燕, 宗雅丽, 张雅妮, 莘似韵, 邱辛瑶, 杨帅, 王红阳, 高栋, 王鹏, 陈磊
《工程（英文）》 2023年 第22卷 第3期 页码 159-170 doi: 10.1016/j.eng.2022.06.008
由于缺乏经证实具备免疫原性的多肽，基于肿瘤抗原的免疫治疗应用受到限制。在本研究中，利用肝胆肿瘤类器官分析了环状RNA（circRNA）作为肿瘤抗原肽新来源的潜力。使用RNA测序（RNA-seq）和基于算法的评分工具，预测出27 个类器官中3950 个肿瘤特异性circRNA 可翻译18 971 条抗原肽。值得注意的是，来自circTBC1D15 的抗原肽YGFNEILKK不仅可以被HLA-ABC呈递，还能活化T细胞，显著降低肿瘤类器官活率。本研究的发现提供了一种产生肿瘤抗原的重要来源，提示肿瘤特异性circRNA 可作为抗肿瘤靶点。
关键词： 肿瘤抗原 患者来源肝胆肿瘤类器官 环状RNA 基于质谱的免疫肽组学
王玉兰, 王保红, 吴俊芳, 江向洋, 唐惠儒, Ole H. Nielsen
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 83-89 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.013
人类微生态是寄居在人体中的微生物聚集体，且主要存在于胃肠道(GIT) 中。肠道微生态随着人体发育而演化，并在人类健康和疾病中起着重要作用。肠道微生态可能与恶性肿瘤有一定联系，如胃癌和结直肠癌；也可能与其他一些疾病有关，如非酒精性脂肪肝(NAFLD)、被称为工业化世界“生活方式疾病”的肥胖和糖尿病、冠心病以及中枢神经系统紊乱虽然分子技术革命为我们更准确地研究肠道微生态提供了必要的工具，但是我们需要更精确地阐明其与某些人类疾病病理变化的关系，明确微生态在不同疾病中的作用是新的治疗策略发展的基础。本文概述了肠道微生态对人类健康的重要影响以及调整肠道菌群结构的潜在用途，如菌群移植用于治疗耐药艰难梭菌(C. difficile) 的感染。通过微生态干预调整肠道区域以改善人类健康的概念虽刚刚兴起，但其治疗意义显著。因此，抑制有害菌、促进有益菌可能会保护人类健康，并且这些努力将为探索发展更加合理的治疗方案打下基础。
利用纳米粒子进行肿瘤分子成像 Review
程震,闫雪峰,孙夕林,申宝忠,Sanjiv Sam Gambhir
《工程（英文）》 2016年 第2卷 第1期 页码 132-140 doi: 10.1016/J.ENG.2016.01.027
基于核稀疏表示的磁共振图像分析及其在脑肿瘤自动分割中的应用 None
Ji-jun TONG, Peng ZHANG, Yu-xiang WENG, Dan-hua ZHU
《信息与电子工程前沿（英文）》 2018年 第19卷 第4期 页码 471-480 doi: 10.1631/FITEE.1620342
关键词： 脑肿瘤分割；核方法；稀疏编码；字典学习
多组学联用揭示花粉过敏基于肠道菌的新机制 Article
韩珮, 李丽莎, 王子熹, 锡琳, 于航, 丛林, 张正威, 符洁, 彭冉, 潘利斌, 马殊荣, 王学艳, 王洪田, 王向东, 王琰, 孙劲旅, 蒋建东
《工程（英文）》 2022年 第15卷 第8期 页码 115-125 doi: 10.1016/j.eng.2021.03.013
标题 作者 时间 类型 操作
人体胃肠道–菌群相互作用的工程学研究模型
Marc Mac Giolla Eain, Joanna Baginska, Kacy Greenhalgh, Joëlle V. Fritz, Frederic Zenhausern, Paul Wilmes
期刊论文
王红阳院士讲恶性肿瘤（2018年5月30日）
2021年03月31日
会议视频
肿瘤特异性环状RNA来源抗原肽被证实存在于肝胆肿瘤中
王文闻, 马莉丽 , 邢政, 苑廷淦, 包金霞, 朱妍静, 赵晓芳, 赵燕, 宗雅丽, 张雅妮, 莘似韵, 邱辛瑶, 杨帅, 王红阳, 高栋, 王鹏, 陈磊
期刊论文
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