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肿瘤特异性环状RNA来源抗原肽被证实存在于肝胆肿瘤中 Article
王文闻, 马莉丽 , 邢政, 苑廷淦, 包金霞, 朱妍静, 赵晓芳, 赵燕, 宗雅丽, 张雅妮, 莘似韵, 邱辛瑶, 杨帅, 王红阳, 高栋, 王鹏, 陈磊
《工程（英文）》 2023年 第22卷 第3期 页码 159-170 doi: 10.1016/j.eng.2022.06.008
由于缺乏经证实具备免疫原性的多肽，基于肿瘤抗原的免疫治疗应用受到限制。在本研究中，利用肝胆肿瘤类器官分析了环状RNA（circRNA）作为肿瘤抗原肽新来源的潜力。使用RNA测序（RNA-seq）和基于算法的评分工具，预测出27 个类器官中3950 个肿瘤特异性circRNA 可翻译18 971 条抗原肽。值得注意的是，来自circTBC1D15 的抗原肽YGFNEILKK不仅可以被HLA-ABC呈递，还能活化T细胞，显著降低肿瘤类器官活率。本研究的发现提供了一种产生肿瘤抗原的重要来源，提示肿瘤特异性circRNA 可作为抗肿瘤靶点。
关键词： 肿瘤抗原 患者来源肝胆肿瘤类器官 环状RNA 基于质谱的免疫肽组学
嵌合抗原受体和调节性T细胞——移植中人类白细胞抗原特异性免疫抑制的潜力 Review
Sabrina Wright, Conor Hennessy, Joanna Hester, Fadi Issa
《工程（英文）》 2022年 第10卷 第3期 页码 30-43 doi: 10.1016/j.eng.2021.10.018
嵌合抗原受体（CAR）是基因工程领域的一项突破，它彻底改变了过继细胞疗法（ACT）领域。表达这些受体的细胞通过在合成的CAR构建体中包含抗原特异性结合区域而被重新定向到预定的靶点。程序化特异性细胞在肿瘤学领域的优势已被临床证明，与同类未修饰的细胞相比，这种细胞具有更高的准确性、效力与更少的脱靶效应。
关键词： 嵌合抗原受体（CAR） 调节性T细胞 异性免疫 CAR设计 基因编辑
利用纳米粒子进行肿瘤分子成像 Review
程震,闫雪峰,孙夕林,申宝忠,Sanjiv Sam Gambhir
《工程（英文）》 2016年 第2卷 第1期 页码 132-140 doi: 10.1016/J.ENG.2016.01.027
基于核稀疏表示的磁共振图像分析及其在脑肿瘤自动分割中的应用 None
Ji-jun TONG, Peng ZHANG, Yu-xiang WENG, Dan-hua ZHU
《信息与电子工程前沿（英文）》 2018年 第19卷 第4期 页码 471-480 doi: 10.1631/FITEE.1620342
关键词： 脑肿瘤分割；核方法；稀疏编码；字典学习
人体前列腺特异性抗原携带含酮基-脱氧壬酮糖酸的N-聚糖 Article
Wei Wang, Tao Zhang, Jan Nouta, Peter A. van Veelen, Noortje de Haan, Theo M. de Reijke, Manfred Wuhrer, Guinevere S.M. Lageveen-Kammeijer
《工程（英文）》 2023年 第26卷 第7期 页码 119-131 doi: 10.1016/j.eng.2023.02.009
Ketodeoxynononic acid (Kdn) is a rather uncommon class of sialic acid in mammals. However, associations have been found between elevated concentrations of free or conjugated Kdn in relation to human cancer progression. Hitherto, there has been a lack of conclusive evidence that Kdn occurs on (specific) human glycoproteins (conjugated Kdn). Here, we report for the first time that Kdn is expressed on prostate-specific antigen (PSA) N-linked glycans derived from human seminal plasma and urine. Interestingly, Kdn was found only in an α2,3-linkage configuration on an antennary galactose, indicating a highly specific biosynthesis. This unusual glycosylation feature was also identified in a urinary PSA cohort in relation to prostate cancer (PCa), although no differences were found between PCa and non-PCa patients. Further research is needed to investigate the occurrence, biosynthesis, biological role, and biomarker potential of both free and conjugated Kdn in humans.
吕桂帅, 程宁涛, 王红阳
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 110-114 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.017
一个多世纪以前，科学家们就首次发现了肿瘤区域中细菌的存在。但是，微生物在肿瘤发生中的作用近年来才被认识到。近几十年来，与肠道菌群失调相关的疾病代表了全世界最严重的一些公共卫生问题。大量的流行病学研究表明，肠道菌群与某些常见肿瘤密切相关。然而，肠道菌群与肿瘤相关联的具体分子机制仍不明确。研究表明，肠道菌群的改变有助于确定肝癌、酒精相关肝病、非酒精性脂肪肝和肝硬化的发生和发展。本文总结了肠道菌群在肿瘤及肝病中的研究进展，综述了肠道菌群与肿瘤和肝病之间的关系。此外，考虑到细菌内稳态的重要性，我们也对益生菌进行了概述，旨在为相关疾病的治疗提供指导。
类器官技术及其在消化系统肿瘤的临床应用 Review
赵晓芳, 姜有海, 刘春良, 侯明慧, 王红阳, 付静
《工程（英文）》 2022年 第9卷 第2期 页码 123-130 doi: 10.1016/j.eng.2021.04.017
消化系统肿瘤包括食管癌、胃癌、结直肠癌、肝癌和胰腺癌，在全球的发病率和死亡率都很高。由于目前的肿瘤研究模型不能完全模拟原始肿瘤的关键特征，常导致基础研究不能转化用于临床实践。肿瘤发病机制的探索和抗癌药物的开发迫切需要更优化的肿瘤模型。利用肿瘤患者的组织可以高效地建立正常和肿瘤类器官。本文总结并讨论了消化系统类器官的构建方法，及其作为一种新模型在基础癌症研究、临床前实践和个性化治疗中的应用。
基于飞秒激光的用于捕获肿瘤细胞的聚合物芯片实验室的智能程序 Article
Annalisa Volpe, Udith Krishnan, Maria Serena Chiriacò, Elisabetta Primiceri, Antonio Ancona, Francesco Ferrara
《工程（英文）》 2021年 第7卷 第10期 页码 1436-1442 doi: 10.1016/j.eng.2020.10.012
基于自然杀伤细胞的癌症免疫疗法的进展和前景 Review
胡渊, 田志刚, 张彩
《工程（英文）》 2019年 第5卷 第1期 页码 106-114 doi: 10.1016/j.eng.2018.11.015
马麟,包晨露,李青,吴静依,潘虹安,李鹏飞,张路霞,詹启敏
《中国工程科学》 2022年 第24卷 第6期 页码 127-136 doi: 10.15302/J-SSCAE-2022.06.011
肿瘤是人类生命健康的重要威胁，随着我国医疗行业信息化的发展，医疗机构积累了大量的肿瘤临床数据，但因数据标准不统一、治理难度大等原因制约了数据价值的充分挖掘；应用人工智能（AI）等前沿信息技术建设肿瘤临床大数据管理系统，有助于肿瘤临床数据的深入应用、临床诊疗管理质量与效率提升。本文剖析了我国肿瘤临床数据治理与应用面临的问题及挑战，研判了肿瘤临床大数据管理体系的应用价值；针对肿瘤临床数据多来源、多模态的复杂特性，探索了AI 技术应用于肿瘤临床大数据管理与科研的机制及路径；设计了包括肿瘤通用数据模型构建相关研究可为丰富我国肿瘤临床大数据管理系统的建设实践、探讨领域未来重点研究方向提供参考和启示。
纳米技术——一种针对促肿瘤中性粒细胞的肺癌治疗新策略 Review
张健, 蒋莎莎, 李仕林, 江继鹏, 梅婕, 陈延东, 马永富, 刘阳, 刘颖
《工程（英文）》 2023年 第27卷 第8期 页码 106-126 doi: 10.1016/j.eng.2022.11.006
原发性肺癌和转移性肺癌都是肺部恶性肿瘤，两者都威胁着患者的生命，但各自的发病机制不同。肿瘤的发生和发展涉及肿瘤细胞与宿主微环境之间的交流，中性粒细胞是肿瘤微环境（TME）中最丰富的免疫细胞，它们参与炎症环境的形成，并通过其抗肿瘤和促肿瘤能力影响患者的生存。中性粒细胞可根据不同的标准分为不同的类别，常见的类别包括 N1 抗肿瘤中性粒细胞和 N2 免疫抑制中性粒细胞。中性粒细胞的抗肿瘤作用是通过活性氧、肿瘤坏死因子相关的细胞凋亡诱导配体、高级糖化终产物受体-胰蛋白酶 G 等因素共同作用以及调节其他免疫细胞的活动共同介导的。中性粒细胞作为肿瘤促进因子，也可通过影响包括癌症发生、血管生成、癌细胞增殖和侵袭能力等过程，促进肺癌的发展和转移，并在其他癌症的肺转移中发挥类似作用。
基于抗原和聚合酶链式反应的组合策略对模拟社区内遏制COVID-19传播效果的定量分析 Article
黄蔷如, 孙艳侠, 贾萌萌, 张婷, 陈方圆, 姜明月, 王晴, 冯录召, 杨维中
《工程（英文）》 2023年 第28卷 第9期 页码 234-242 doi: 10.1016/j.eng.2023.01.004
调节性T细胞及其在抗肿瘤免疫疗法中的临床应用 Review
解丰, 梁瑞, 李丹, 李斌
《工程（英文）》 2019年 第5卷 第1期 页码 132-139 doi: 10.1016/j.eng.2018.12.002
癌症是可能危及生命的疾病，特点在于肿瘤细胞在宿主身上无限增殖。最近，因其具有预防肿瘤进展和转移的巨大潜力，免疫疗法受到越来越多研究者的关注。调节性T 细胞（Treg）是对维持宿主免疫稳态起重要作用的抑制性CD4+ T 细胞的一个亚群。调节性T 细胞通常富集在肿瘤微环境中，而大量免疫抑制调节性T细胞往往表明预后较差。因此，人们对调节性T 细胞的功能及其在抗肿瘤免疫疗法中的临床应用再次产生了兴趣。越来越多的策略关注调节性T 细胞的消耗，这在抗肿瘤免疫方面似乎有效。预计调节性T 细胞靶向策略与其他疗法（如嵌合抗原受体T 细胞疗法或免疫检查点阻断）联用将为提高抗肿瘤疗效带来重大机遇。
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肿瘤特异性环状RNA来源抗原肽被证实存在于肝胆肿瘤中
王文闻, 马莉丽 , 邢政, 苑廷淦, 包金霞, 朱妍静, 赵晓芳, 赵燕, 宗雅丽, 张雅妮, 莘似韵, 邱辛瑶, 杨帅, 王红阳, 高栋, 王鹏, 陈磊
期刊论文
人体前列腺特异性抗原携带含酮基-脱氧壬酮糖酸的N-聚糖
Wei Wang, Tao Zhang, Jan Nouta, Peter A. van Veelen, Noortje de Haan, Theo M. de Reijke, Manfred Wuhrer, Guinevere S.M. Lageveen-Kammeijer
期刊论文
基于飞秒激光的用于捕获肿瘤细胞的聚合物芯片实验室的智能程序
Annalisa Volpe, Udith Krishnan, Maria Serena Chiriacò, Elisabetta Primiceri, Antonio Ancona, Francesco Ferrara
期刊论文
京公网安备 11010502051620号
