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2008—2017年河南省腹泻患者来源单相鼠伤寒沙门菌ST34的基因组流行病学特征研究 Article
穆玉娇, 李瑞超, 杜鹏程, 张沛, 李岩, 崔生辉, Séamus Fanning, 白莉
《工程（英文）》 2022年 第15卷 第8期 页码 34-44 doi: 10.1016/j.eng.2022.05.006
单相鼠伤寒沙门菌（Salmonella enterica serovar 4,[5],12:i:-, S. 4,[5],12:i:-）作为鼠伤寒沙门菌的变种，已成为全球公共卫生领域备受关注的新兴血清型>TEM-1B（氨苄西林耐药）、strAB（链霉素耐药）、sul2（磺胺类耐药）和tet(B)（四环素耐药）]，导致了血清型单相变异
基于链置换环介导等温扩增的量子点纳米珠标记侧流免疫检测试纸条快速灵敏检测鼠伤寒沙门氏菌 Article
Yuting Shang,Shuzhen Cai,Qinghua Ye,Qingping Wu,Yanna Shao,Xiaoying Qu,Xinran Xiang,Baoqing Zhou,Yu Ding,Moutong Chen,Liang Xue,Honghui Zhu,Jumei Zhang
《工程（英文）》 2022年 第19卷 第12期 页码 62-70 doi: 10.1016/j.eng.2021.03.024
甘油诱导的鼠李糖脂增强伯克霍尔德菌属C3中二苯并噻吩的生物降解 Article
Camila A. Ortega Ramirez, Abraham Kwan, Qing X. Li
《工程（英文）》 2020年 第6卷 第5期 页码 533-540 doi: 10.1016/j.eng.2020.01.006
高子航, 贾广禄, 谢宏钊, 黄强, 福田敏男, 石青
《工程（英文）》 2022年 第17卷 第10期 页码 232-243 doi: 10.1016/j.eng.2022.05.012
现有的仿生机器鼠仅可以执行一些基本的仿鼠运动基元（MP），并通过这些基元的刚性组合来形成简单的行为。为了模拟具有高相似性的典型实验鼠行为，本文提出使用概率模型和运动特征对实验鼠的行为进行参数化。首先，对15 个10 min 的实验鼠运动视频片段的分析表明，一只实验鼠在野外通常有6 种典型的行为，且每种行为都包含8 个运动基元的不同组合。这些优势值通过二阶傅里叶级数对实验鼠的脊柱关节轨迹进行拟合，并且通过具有两个隐藏层的反向传播（BP）神经网络对关节轨迹进行泛化。最后，将分层概率模型和泛化的关节轨迹分别作为控制策略和指令映射到机器鼠。本文在机器鼠上实现了6 种典型的仿鼠行为，其结果与实验鼠的行为相比显示出高度相似性。
从H1N1血凝素序列提取的沙门氏菌传递的COBRA-HA1抗原对甲型流感亚型产生广谱保护作用 Article
Ram Prasad Aganja, Amal Senevirathne, Chandran Sivasankar, John Hwa Lee
《工程（英文）》 2024年 第32卷 第1期 页码 42-57 doi: 10.1016/j.eng.2023.08.001
A universal vaccine is in high demand to address the uncertainties of antigenic drift and the reduced effectiveness of current influenza vaccines. In this study, a strategy called computationally optimized broadly reactive antigen (COBRA) was used to generate a consensus sequence of the hemagglutinin globular head portion (HA1) of influenza virus samples collected from 1918 to 2021 to trace evolutionary changes and incorporate them into the designed constructs. Constructs carrying different HA1 regions were delivered into eukaryotic cells by Salmonella-mediated bactofection using a Semliki Forest virus RdRp-dependent eukaryotic expression system, pJHL204. Recombinant protein expression was confirmed by Western blot and immunofluorescence assays. Mice immunized with the designed constructs produced a humoral response, with a significant increase in immunoglobulin G (IgG) levels, and a cell-mediated immune response, including a 1.5-fold increase in CD4+ and CD8+ T cells. Specifically, constructs #1 and #5 increased the production of interferon-γ (IFN-γ) producing CD4+ and CD8+ T cells, skewing the response toward the T helper type 1 cell (Th1) pathway. Additionally, interleukin-4 (IL-4)-producing T cells were upregulated 4-fold. Protective efficacy was demonstrated, with up to 4-fold higher production of neutralizing antibodies and a hemagglutination inhibition titer > 40 against the selected viral strains. The designed constructs conferred a broadly protective immune response, resulting in a notable reduction in viral titer and minimal inflammation in the lungs of mice challenged with the influenza A/PR8/34, A/Brisbane/59/2007, A/California/07/2009, KBPV VR-92, and NCCP 43021 strains. This discovery revolutionizes influenza vaccine design and delivery; Salmonella-mediated COBRA-HA1 is a highly effective in vivo antigen presentation strategy. This approach can effectively combat seasonal H1N1 influenza strains and potential pandemic outbreaks.
关键词： COBRA Influenza A Salmonella Vaccine Broad spectral protection
鱼类肠道菌群研究进展及潜在应用 Review
栾银银, 黎明, 周伟, 药园园, 杨雅麟, 张震, Einar Ringø, Rolf Erik Olsen, Jihong Liu Clarke, 解绶启, 麦康森, 冉超, 周志刚
《工程（英文）》 2023年 第29卷 第10期 页码 137-146 doi: 10.1016/j.eng.2022.12.011
肠道菌群在宿主健康和疾病中起着重要作用。我们对鱼类菌群的理解远落后于人类和其他哺乳动物。尽管如此，现有研究也强调了微生物对鱼类的健康、生长性能和各种生理功能中的重要性。鱼类菌群的组成取决于宿主选择、饮食和环境等因素。肠道菌群可以影响鱼类宿主的营养代谢、免疫和抗病能力，而宿主则通过免疫和非免疫因素以鱼菌互作的方式调节肠道菌群的稳态。在本篇综述中，我们讨论了鱼类微生物研究的最新进展，描述了包括鱼类微生物多样性，以及宿主-菌群交互作用的研究结果。同时，还讨论了鱼类菌群对鱼类健康及行业可持续发展的潜在作用。
王玉兰, 王保红, 吴俊芳, 江向洋, 唐惠儒, Ole H. Nielsen
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 83-89 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.013
赵浏阳, 张翔, 左涛, 于君
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 90-97 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.012
甘玲玲,王蔚芳,高淳仁,雷霁霖
《中国工程科学》 2014年 第16卷 第9期 页码 21-25
深古菌门的核心代谢功能和热环境起源 Article
冯晓远, 王寅炤, Rahul Zubi, 王风平
《工程（英文）》 2019年 第5卷 第3期 页码 498-504 doi: 10.1016/j.eng.2019.01.011
深古菌门具有复杂的亚群分类，是地球上丰度最高的微生物之一。然而，深古菌的代谢特征和演化历史仍然有待进一步研究。本研究对来自10个不同亚群的15个新获得和36个已经发表的深古菌基因组进行了比较基因组分析，揭示了深古菌门的核心代谢特征，即蛋白质、脂质、芳香族化合物降解，糖酵解途径和Wood–Ljungdahl上述核心代谢特征表明深古菌使用乙酰辅酶A作为重要的代谢中间物。此外，部分深古菌亚群还具有不完整的柠檬酸循环、产乙酸途径和硫化物相关的代谢潜能，表明不同亚群具有多样的代谢能力和生态功能。亚群Bathy-21和Bathy-22位于深古菌系统发育树根部，是目前已知最古老的两个深古菌亚群。综上，本研究对深古菌门的核心代谢能力进行了系统性研究和总结，并揭示了深古菌热环境起源的演化历史。
李芬妮 ,张俊飚 ,姚方杰, 傅廷栋
《中国工程科学》 2019年 第21卷 第4期 页码 105-110 doi: 10.15302/J-SSCAE-2019.04.009
吕桂帅, 程宁涛, 王红阳
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 110-114 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.017
肠道菌群调节在肝细胞癌和肝移植中的应用 Review
向泽, 吴健, 李佳芮, 郑树森, 魏绪勇, 徐骁
《工程（英文）》 2023年 第29卷 第10期 页码 59-72 doi: 10.1016/j.eng.2022.12.012
标题 作者 时间 类型 操作
基于链置换环介导等温扩增的量子点纳米珠标记侧流免疫检测试纸条快速灵敏检测鼠伤寒沙门氏菌
Yuting Shang,Shuzhen Cai,Qinghua Ye,Qingping Wu,Yanna Shao,Xiaoying Qu,Xinran Xiang,Baoqing Zhou,Yu Ding,Moutong Chen,Liang Xue,Honghui Zhu,Jumei Zhang
期刊论文
从H1N1血凝素序列提取的沙门氏菌传递的COBRA-HA1抗原对甲型流感亚型产生广谱保护作用
Ram Prasad Aganja, Amal Senevirathne, Chandran Sivasankar, John Hwa Lee
期刊论文
鱼类肠道菌群研究进展及潜在应用
栾银银, 黎明, 周伟, 药园园, 杨雅麟, 张震, Einar Ringø, Rolf Erik Olsen, Jihong Liu Clarke, 解绶启, 麦康森, 冉超, 周志刚
期刊论文
白莉：新发耐药沙门菌的流行特征和人群暴露风险（2022年8月31日）
2022年10月17日
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