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结直肠癌、基质和正常结肠黏膜显微解剖区域N-糖组的显著多样性 Article
Di Wang, Katarina Madunić , Tao Zhang, Guinevere S.M. Lageveen-Kammeijer, Manfred Wuhrer
《工程(英文)》 2023年 第26卷 第7期 页码 32-43 doi: 10.1016/j.eng.2022.08.016
Aberrant glycosylation is considered to be a hallmark of colorectal cancer (CRC), as demonstrated by various studies. While the N-glycosylation of cell lines and serum has been widely examined, the analysis of cancer-associated N-glycans from tissues has been hampered by the heterogeneity of tumors and the complexity of N-glycan structures. To overcome these obstacles, we present a study using laser capture microdissection that makes it possible to largely deconvolute distinct N-glycomic signatures originating from different regions of heterogeneous tissues including cancerous, stromal, and healthy mucosa cells. N-glycan alditols were analyzed by means of porous graphitized carbon liquid chromatography-electrospray ionization tandem mass spectrometry, enabling the differentiation and structural characterization of isomeric species. In total, 116 N-glycans were identified that showed profound differences in expression among cancer, stroma, and normal mucosa. In comparison with healthy mucosa, the cancer cells showed an increase in α2-6 sialylation and monoantennary N-glycans, as well as a decrease in bisected N-glycans. Moreover, specific sialylated and (sialyl-)LewisA/X antigen-carrying N-glycans were exclusively expressed in cancers. In comparison with cancer, the stroma showed lower levels of oligomannosidic and monoantennary N-glycans, LewisA/X epitopes, and sulfation, as well as increased expression of (core-)fucosylation and α2-3 sialylation. Our study reveals the distinct N-glycomic profiles of different cell types in CRC tumor and control tissues, proving the necessity of their separate analysis for the discovery of cancer-associated glycans.
关键词: 结直肠癌 肿瘤 多孔石墨化碳液相色谱-质谱 N-糖组 抗体反应
赵浏阳, 张翔, 左涛, 于君
《工程(英文)》 2017年 第3卷 第1期 页码 90-97 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.012
结直肠癌是由遗传突变、表观遗传改变、慢性炎症、饮食和生活方式等多因素引起的多阶段疾病。最新研究表明,肠道菌群是结直肠癌发展过程中的重要参与者。肠道菌群稳态的失调,可通过诱发炎症、调控宿主防御、氧化应激和改变细菌代谢产物等机制促进结直肠癌的发生发展。值得注意的是,肠道横、纵截面上不同解剖部位的驻留菌群有所不同。由于结肠共生细菌的易位与结直肠癌的发展密切相关,结直肠癌相关细菌可有望成为用于结直肠癌诊断的非侵入且准确性高的新型生物标志物。本文旨在总结和概述肠道不同解剖部位中的肠道菌群在结直肠癌发生发展中的作用。
转移性结直肠癌治疗模式随时间的变化趋势以及其与患者生存期的关系——一项基于智能大数据平台的回顾性队列研究 Article
王梓贤, 姚逸尘, 麦宗炯, 林武豪, 黄酉生, 金颖, 骆卉妍, 张东生, 王风华, 王峰, 陈功, 丁培荣, 元云飞, 李宇红, 黄金华, 潘志忠, 徐瑞华
《工程(英文)》 2021年 第7卷 第4期 页码 526-533 doi: 10.1016/j.eng.2020.10.017
目前,尤其是在国内,仍缺乏大规模的、高质量的转移性结直肠癌(metastatic colorectal cancer, mCRC)真实世界数据。基于智能大数据平台,我们建立了一个大样本的mCRC回顾性队列。我们分析了全身性治疗及局部治疗手段[包括肝转移、肺转移或肝外和(或)肺外转移灶的手术切除、射频消融以及立体定向放疗]随年份的变化趋势,以及分析了这些改变是否可改善患者的总生存期(overall survival本研究队列的中位OS为42.8个月[95% 置信区间(confidence interval, CI),40.7~46.6];其中,仅接受了全身性治疗的患者的中位OS为25.6个月(95% CI, 24.7综上,本队列研究表明mCRC全身性治疗及局部治疗的使用率的提高可以为患者带来生存获益。
发生于胃和结直肠的印戒细胞癌的临床特征以及不同部位的转移对预后的预测价值的研究 Article
吴静静, 方戴琼, 满达, 吴文瑞, 王清, 李雅婷, 叶建中, 李兰娟
《工程(英文)》 2020年 第6卷 第9期 页码 1028-1034 doi: 10.1016/j.eng.2020.06.007
印戒细胞癌是胃、结直肠肿瘤中恶性程度最高的病理类型之一。本研究分析了印戒细胞癌的转移特性及其对肿瘤特异性生存率的影响。这项研究纳入了4055例在2010—2012年被诊断为胃印戒细胞癌(signet ring cell carcinoma, SRCC)、结直肠印戒细胞癌患者,其中胃印戒细胞癌2905例,结肠印戒细胞癌和直肠印戒细胞癌我们通过卡方检验分析在确诊时伴有远处转移的患者及无远处转移的患者的临床特征。同时用Kaplan-Meier、Cox风险比例回归模型分析出现不同部位转移的患者的预后差异。研究发现,在胃印戒细胞癌患者中,远处淋巴结转移是其最常见的转移部位,而出现脑转移的患者其预后最差。而在患有结肠或直肠的印戒细胞癌患者中,肝脏是其最常见的转移部位,而在确诊时出现远处淋巴结转移的患者的拥有最高的死亡率。
结直肠癌黏膜组织来源的大肠杆菌菌株间遗传和功能差异研究 Article
常宇骁, 李享, 丁磊, 杨超, 潘志远, 韩妮, 崔玉军, 智发朝, 杨瑞馥, 高宏,毕玉晶
《工程(英文)》 2022年 第16卷 第9期 页码 210-219 doi: 10.1016/j.eng.2021.03.028
结直肠癌是全球第三大癌症。宏基因组学已被广泛用于基于细菌属或种水平的比较来分析肠道微生物群与结直肠癌之间的关系,为结直肠癌发展中的生态失调提供了证据。然而,这种分析并不能为我们提供菌株水平的信息,进而理解一种细菌在结直肠癌发生发展中菌株水平的作用。本文利用培养组学方法分离结直肠癌黏膜样本,并选择了158株大肠杆菌,通过系统发育分析和炎症诱导实验,揭示它们在基因组学和功能上的差异。基因组比较可以将这些菌株分为5个系统群。选择代表性菌株进行THP-1细胞(人白血病单核细胞)Transwell实验以及动物实验,结果显示不同菌株经刺激后,细胞因子水平有显著性差异。
从结直肠癌细胞和组织样本释放的外泌体中检测肿瘤相关抗原自身抗体的多路生物传感诊断平台展示了对结直肠癌的高诊断能力 Article
Ana Montero-Calle, Itziar Aranguren-Abeigon, María Garranzo-Asensio, Carmen Poves, María Jesús Fernández-Aceñero, Javier Martínez-Useros, Rodrigo Sanz, Jana Dziaková, Javier Rodriguez-Cobos, Guillermo Solís-Fernández, Eloy Povedano, Maria Gamella, Rebeca Magnolia Torrente-Rodríguez, Miren Alonso-Navarro, Vivian de los Ríos, J. Ignacio Casal, Gemma Domínguez, Ana Guzman-Aranguez, Alberto Peláez-García, José Manuel Pingarrón, Susana Campuzano, Rodrigo Barderas
《工程(英文)》 2021年 第7卷 第10期 页码 1393-1412 doi: 10.1016/j.eng.2021.04.026
约束优化下的霍曼转移 None
Li XIE, Yi-qun ZHANG, Jun-yan XU
《信息与电子工程前沿(英文)》 2018年 第19卷 第11期 页码 1444-1458 doi: 10.1631/FITEE.1800295
关键词: 霍曼转移;非线性规划;约束优化;变分法
生物质制备纳米零价铁生物炭的铁相转移和原位还原机制 Article
卓胜男, 任宏宇, 谢国俊, 邢德峰, 刘冰峰
《工程(英文)》 2023年 第21卷 第2期 页码 124-134 doi: 10.1016/j.eng.2021.07.012
纳米零价铁生物炭(nZVI-BC)作为一种由废弃生物质制备的环境友好型材料,可有效解决生物质转化和环境污染问题。然而,复杂的生物质/生物炭改性过程阻碍了它们的进一步生产和应用。在本研究中,一种绿色溶剂聚乙二醇400(PEG400)被引入FeCl3⋅6H2O改性水稻秸秆(RS)的反应体系中,改性后的RS通过一步热解法被转化为nZVI-BC。PEG400 的添加促进了铁离子的水解并改善了RS的表面结构,有利于Fe2O3附着到RS表面。在60 ℃、80 ℃、100 ℃和0.5 h 的改性条件下,RS中木质素组分损失不多,有利于高温热解过程中碳骨架的形成。Fe2O3在热解产生的还原气体和无定形碳的帮助下被还原,最终形成nZVI-BC。将该方法制备的nZVI-BC 用于染料刚果红的催化高级氧化去除,结果表明,nZVI-BC 具有快速的吸附能力(5 min 时吸附效果为70.6%)和高效的催化降解能力(60 min 时催化降解90%)。本研究为nZVI-BC的制备提供了一种新的策略,为其规模化生产和应用奠定了基础。
曹结东,李永池
《中国工程科学》 2006年 第8卷 第1期 页码 40-45
外泌体CD44与整合素α6β4结合激活宿主细胞重塑肿瘤微环境促进胰腺癌恶性转移 Article
牟为, 许亚婕, 顾鹏飞, 王文斌, 李井泉, 葛阳, 王慧
《工程(英文)》 2021年 第7卷 第10期 页码 1415-1425 doi: 10.1016/j.eng.2020.08.013
标题 作者 时间 类型 操作
结直肠癌、基质和正常结肠黏膜显微解剖区域N-糖组的显著多样性
Di Wang, Katarina Madunić , Tao Zhang, Guinevere S.M. Lageveen-Kammeijer, Manfred Wuhrer
期刊论文
转移性结直肠癌治疗模式随时间的变化趋势以及其与患者生存期的关系——一项基于智能大数据平台的回顾性队列研究
王梓贤, 姚逸尘, 麦宗炯, 林武豪, 黄酉生, 金颖, 骆卉妍, 张东生, 王风华, 王峰, 陈功, 丁培荣, 元云飞, 李宇红, 黄金华, 潘志忠, 徐瑞华
期刊论文
从结直肠癌细胞和组织样本释放的外泌体中检测肿瘤相关抗原自身抗体的多路生物传感诊断平台展示了对结直肠癌的高诊断能力
Ana Montero-Calle, Itziar Aranguren-Abeigon, María Garranzo-Asensio, Carmen Poves, María Jesús Fernández-Aceñero, Javier Martínez-Useros, Rodrigo Sanz, Jana Dziaková, Javier Rodriguez-Cobos, Guillermo Solís-Fernández, Eloy Povedano, Maria Gamella, Rebeca Magnolia Torrente-Rodríguez, Miren Alonso-Navarro, Vivian de los Ríos, J. Ignacio Casal, Gemma Domínguez, Ana Guzman-Aranguez, Alberto Peláez-García, José Manuel Pingarrón, Susana Campuzano, Rodrigo Barderas
期刊论文
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