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基因组 4

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不同类型意大利蜜蜂MDH Ⅱ同工酶的研究

陈盛禄,鲍秀良,苏松坤,刘艳荷

《中国工程科学》 2000年 第2卷 第1期   页码 57-61

摘要: )、美国意蜂(美意,Em)、澳大利亚意蜂(澳意Eo)、意大利意蜂(原意,Ee)等5个意大利蜂(Apis mellifera Ligustica)品种试飞前的幼龄工蜂进行了苹果酸脱氢酶(MDH)同工酶的基因基因频率、基因频率、杂合度和纯合度的研究。由a、b、c 3个等位基因编码的MDH图谱第二区带应有的a/a、a/b、a/c、b/b、b/c和c/c 6种基因,在Ea、Eb、Ee 3种意蜂中全部出现;在Eo中出现a/b,a/c,b/c,c/c 4联列表独立性检验结果,5个意蜂品种间的基因频率、基因频率、杂合度、纯合度存在显著差异。

关键词: 意蜂品种     苹果酸脱氢酶     基因     基因频率     杂合度    

用于定义系统表现特征的基因与表型仓库数据库的信息图式构造方法 Article

Shahab POURTALEBI,Imre HORVÁTH

《信息与电子工程前沿(英文)》 2016年 第17卷 第9期   页码 862-884 doi: 10.1631/FITEE.1600997

摘要: 实现该工具箱的难点在于其仓库的计算实现不依赖于功能设计和语言,和对于多种不断演变的SMF(基因、表型及实例)工具的系统化的开发和管理。本文中我们给出了创建基因和表型所必需的信息模式构造。这些信息模式构造提高了数据库的开发效率,并使数据之间的联系透明化。下一步研究中我们将重点关注基于SMF实例的系统建模方法的实施细节。

关键词: 信息物理系统;软件工具箱;预实体化设计;系统表现特征;仓库;数据库图式;基因系统表现特征;表型系统表现特征;实例系统表现特征;信息模式构造    

系统表现特征实例化和构成的信息模式构造 Article

Shahab POURTALEBI, Imre HORVÁTH

《信息与电子工程前沿(英文)》 2017年 第18卷 第9期   页码 1396-1415 doi: 10.1631/FITEE.1601235

摘要: 首先,简要介绍了(1)利用SMFs进行具体化设计的一般过程,(2)创建基因和表型SMFs的步骤,(3)表型SMFs实例化的具体步骤,以及(4)系统模型管理和处理的步骤。

关键词: 系统表现特征;信息模式构造;数据库纲要;基因系统表现特征;表型系统表现特征;系统表现特征实例;软件工具箱;系统层级设计;信息物理系统    

哈密瓜南移东进生态育种与有机生态无土栽培技术研究

吴明珠,伊鸿平,冯炯鑫,艾尔肯,张永兵

《中国工程科学》 2000年 第2卷 第8期   页码 83-88

摘要:

脆肉哈密瓜原产新疆大漠干旱或半干旱地区,种植范围狭窄。经过8年16季南、北生态育种的探索研究,利用多种生态地区的亲本杂交、回交,核辐射诱变以及基因工程等手段结合常规选育,已育出8个哈密瓜改良品种(系)和3个单性花自交系,可在我国潮湿多雨、弱光照的东南部采用大棚有机生态无土栽培方式种植

关键词: 哈密瓜     生态育种     核辐射诱变     基因工程     有机生态     无土栽培     单性花    

痰湿体质的分子生物学特征

王琦,董静,吴宏东,王东坡,姚实林,任小娟

《中国工程科学》 2008年 第10卷 第7期   页码 100-103

摘要: 文章以探索痰湿质的分子机制为目的,在临床流行病学调查的基础上,分别选择6例典型痰湿质和6例典型平和质受试对象,采用 Affymetrix GeneChip Mapping 500K Array检测技术检测基因组DNA,结合前期基因表达谱芯片分析痰湿质的差异表达基因结果,筛选痰湿质相关基因及单核苷酸多态性位点。试对痰湿质与平和质组间表达有显著差异的442个基因进行分析,与平和质比较,初步筛选出痰湿质 5个相关基因共 6 个 SNP 位点。同时进一步对相关基因功能分析显示,痰湿体质相关基因主要基因功能为酶活性、固醇运载体 活性等功能,参与糖异生途径、脂肪酸生物合成途径、胆固醇代谢过程、脂肪酸氧化作用、棕色脂肪细胞分化、 细胞葡萄糖调节平衡作用

关键词: 痰湿体质     SNP基因芯片     分子生物学特征    

人类遗传病的家系收集疾病基因定位克隆与疾病基因功能的研究

夏家辉

《中国工程科学》 2000年 第2卷 第11期   页码 1-11

摘要:

介绍了中国医学遗传学国家重点实验室在遗传病家系收集、疾病基因定位、疾病基因克隆和疾病基因功能研究方面的研究工作。用细胞遗传学G显带技术于1975年发现了一条与鼻咽癌相关的标记染色体t(1;3)(q44;p11);1981年将睾丸决定基因(TDF)定位于Yp11.32带;1991年以来收集遗传病家系345种共590个;1996年用显微切割、PCR、微克隆技术克隆了EXT2基因;1998年用基因家族-候选疾病基因克隆方法克隆了遗传性神经性耳聋基因GJB3;1999年用连锁分析和全基因组扫描将一种遗传性弥漫性浅表性光敏性汗孔角化症定位于12q23.2带,并在基因功能研究中发现了一个新的细胞内转运蛋白。

关键词: 遗传病家系     基因定位和克隆     基因家族-候选疾病基因克隆     基因组扫描     基因功能研究    

油菜转基因育种研究进展

官春云

《中国工程科学》 2002年 第4卷 第8期   页码 34-39

摘要:

简要介绍了国外油菜转基因育种情况,包括转除草剂抗性基因,病原菌抗性基因,耐重金属基因, 影响种子贮藏产物基因,影响繁殖特性基因,医药和工业产品基因,以及启动子调节基因等。较详细介绍了湖 南农业大学在Bt毒蛋白基因转化甘蓝油菜育成抗虫新品系、基因工程雄性不育系、恢复系选育和杂种优势利 用,以及反义FAD2基因转化甘蓝油菜双低品种提高油酸含量的研究结果;浙江省农科院利用反义PEP基因 转化甘蓝油菜提高种子含油量的研究结果。

关键词: 油菜     基因     育种    

全息胚学说对当前基因工程问题的解决策略——多基因获得与期望性状强化技术

王瑞库

《中国工程科学》 2006年 第8卷 第5期   页码 25-28

摘要: 全息胚学说可以解决转基因工程中存在的某些问题,为生物遗传操作开辟了一条新途径。阐述了建立在全息胚学说基础之上的全息胚基因工程的理论基础、技术原理,分析了技术的实质和关键,提出操作方案,并对其应用前景进行了描述。

关键词: 全息胚     基因工程     解决策略     基因获得     期望性状强化    

人类蛋白质N-糖基化的十二年全基因组关联研究 Review

Anna Timoshchuk, Sodbo Sharapov, Yurii S. Aulchenko

《工程(英文)》 2023年 第26卷 第7期   页码 17-31 doi: 10.1016/j.eng.2023.03.013

摘要:

Most human-secreted and membrane-bound proteins have covalently attached oligosaccharide chains, or glycans. Glycosylation influences the physical and chemical properties of proteins, as well as their biological functions. Unsurprisingly, alterations in protein glycosylation have been implicated in a growing number of human diseases, and glycans are increasingly being considered as potential therapeutic targets, an essential part of therapeutics, and biomarkers. Although glycosylation pathways are biochemically well-studied, little is known about the networks of genes that guide the cell- and tissue-specific regulation of these biochemical reactions in humans in vivo. The lack of a detailed understanding of the mechanisms regulating glycome variation and linking the glycome to human health and disease is slowing progress in clinical applications of human glycobiology. Two of the tools that can provide much sought-after knowledge of human in vivo glycobiology are human genetics and genomics, which offer a powerful data-driven agnostic approach for dissecting the biology of complex traits. This review summarizes the current state of human populational glycogenomics. In Section 1, we provide a brief overview of the N-glycan's structural organization, and in Section 2, we give a description of the major blood plasma glycoproteins. Next, in Section 3, we summarize, systemize, and generalize the results from current N-glycosylation genome-wide association studies (GWASs) that provide novel knowledge of the genetic regulation of the populational variation of glycosylation. Until now, such studies have been limited to an analysis of the human blood plasma N-glycome and the N-glycosylation of immunoglobulin G and transferrin. While these three glycomes make up a rather limited set compared with the enormous multitude of glycomes of different tissues and glycoproteins, the study of these three does allow for powerful analysis and generalization. Finally, in Section 4, we turn to genes in the established loci, paying particular attention to genes with strong support in Section 5. At the end of the review, in Sections 6 and 7, we describe special cases of interest in light of new discoveries, focusing on possible mechanisms of action and biological targets of genetic variation that have been implicated in human protein N-glycosylation.

关键词: 糖组学     聚糖     N-糖基化     基因组学     遗传学     基因组关联研究    

基因作物

Lance A. Davis

《工程(英文)》 2016年 第2卷 第3期   页码 268-269 doi: 10.1016/J.ENG.2016.03.007

极地动物基因资源研究现状与发展战略

陈松林,徐文腾,陈张帆

《中国工程科学》 2019年 第21卷 第6期   页码 39-47 doi: 10.15302/J-SSCAE-2019.06.007

摘要:

本文主要从基因组和转录组层面分析了极地动物基因资源的研究现状,梳理了本领域研究中存在的问题,并提出了未来发展战略。极地动物基因组测序起步较晚,迄今只完成了 13种极地动物的全基因组测序。在转录组研究方面,人们对极地的 31个物种进行了转录组测序,并在以下四个方向重点开展了研究:环境适应性研究;污染物应激反应的分子机制研究;不同发育阶段或不同组织中的转录组分析;功能基因挖掘。本领域研究由于起步晚,研究广度和深度都有待加强,但极地动物的基因资源研究具有战略意义。建议国家设立“极地动物基因资源发掘与应用”重点研发计划专项,围绕极地渔业动物特殊性状遗传解析、特有基因功能分析和基因工程产品研发等开展研究。

关键词: 极地动物     基因组,转录组,基因资源    

美国转基因大西洋鲑产业化对我国的启示

胡炜,朱作言

《中国工程科学》 2016年 第18卷 第3期   页码 105-109 doi: 10.15302/J-SSCAE-2016.03.018

摘要:

2015年11月19日,美国食品药品监督管理局(FDA)批准了转全鱼生长激素基因(gh)大西洋鲑为第一种可供食用的转基因动物产品,从而取得世界转基因动物育种研究与产业化的历史性突破。经过了长达20年的严格审核,转gh大西洋鲑才获准产业化,不仅充分说明了对包括转基因鱼在内的创新产业的管理决策尤其需要尊重科学规律和客观事实;而且表明基础研究只是产业创新的因素之一,转基因知识的科学普及与企业的积极参与是推动高新技术发展和创新产业形成不可或缺的重要条件;高屋建瓴地制定我国基因改良农业品种市场准入的条例和操作细则已经刻不容缓。

关键词: 基因     大西洋鲑     产业化     启示    

纳米复合肺靶向递送突破Ad5预存免疫屏障 Article

杨益隆, 吴诗坡, 王玉东, 邵方泽, 吕鹏, 李汭桦, 赵晓帆, 张军, 张晓鹏, 李建民, 侯利华, 徐俊杰, 陈薇

《工程(英文)》 2023年 第27卷 第8期   页码 127-139 doi: 10.1016/j.eng.2022.12.007

摘要:

重组5腺病毒载体(Ad5)已成功用于埃博拉病毒、新型肺炎冠状病毒等新发突发传染病防控,然而针对病毒载体的预存免疫会对疫苗的免疫原性造成一定影响。维持重组Ad5疫苗的高免疫原性并减少预存免疫效应,已成为该领域的重要研究方向。基于生物相容性纳米颗粒,本研究尝试通过调控Ad5与宿主的相互作用应对上述挑战。制备出的正电人血清白蛋白纳米颗粒[(+)HSAnp]能够与Ad5自组装形成复合物,针对柯萨奇病毒-腺病毒受体(CAR)阳性和阴性细胞均能显著提高靶基因表达量。在小鼠模型中,滴鼻吸入Ad5/(+)HSAnp复合物实现了高效(高达227倍)和长期(长达60天)的肺靶向靶基因表达,且增强效应可通过表面电位和给药剂量进行调控。经纳米复合的5腺病毒载体埃博拉疫苗和新冠疫苗,在Ad5预存免疫模型中显著增强了体液免疫和黏膜免疫应答。本研究表明通过纳米颗粒调控病毒载体的聚集状态和表面电位,能够用于设计增强的疫苗和基因治疗载体。

关键词: 5腺病毒     疫苗     预存免疫     纳米颗粒     基因表达    

材料基因组计划与先进材料

陈立泉

《工程(英文)》 2015年 第1卷 第2期   页码 169-169 doi: 10.15302/J-ENG-2015056

基因组测序成本将再次降低

Robert Pollie

《工程(英文)》 2023年 第23卷 第4期   页码 3-6 doi: 10.1016/j.eng.2023.02.002

标题 作者 时间 类型 操作

不同类型意大利蜜蜂MDH Ⅱ同工酶的研究

陈盛禄,鲍秀良,苏松坤,刘艳荷

期刊论文

用于定义系统表现特征的基因与表型仓库数据库的信息图式构造方法

Shahab POURTALEBI,Imre HORVÁTH

期刊论文

系统表现特征实例化和构成的信息模式构造

Shahab POURTALEBI, Imre HORVÁTH

期刊论文

哈密瓜南移东进生态育种与有机生态无土栽培技术研究

吴明珠,伊鸿平,冯炯鑫,艾尔肯,张永兵

期刊论文

痰湿体质的分子生物学特征

王琦,董静,吴宏东,王东坡,姚实林,任小娟

期刊论文

人类遗传病的家系收集疾病基因定位克隆与疾病基因功能的研究

夏家辉

期刊论文

油菜转基因育种研究进展

官春云

期刊论文

全息胚学说对当前基因工程问题的解决策略——多基因获得与期望性状强化技术

王瑞库

期刊论文

人类蛋白质N-糖基化的十二年全基因组关联研究

Anna Timoshchuk, Sodbo Sharapov, Yurii S. Aulchenko

期刊论文

基因作物

Lance A. Davis

期刊论文

极地动物基因资源研究现状与发展战略

陈松林,徐文腾,陈张帆

期刊论文

美国转基因大西洋鲑产业化对我国的启示

胡炜,朱作言

期刊论文

纳米复合肺靶向递送突破Ad5预存免疫屏障

杨益隆, 吴诗坡, 王玉东, 邵方泽, 吕鹏, 李汭桦, 赵晓帆, 张军, 张晓鹏, 李建民, 侯利华, 徐俊杰, 陈薇

期刊论文

材料基因组计划与先进材料

陈立泉

期刊论文

基因组测序成本将再次降低

Robert Pollie

期刊论文