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王娜,郭欣妍,单正军,蔡道基
《中国工程科学》 2021年 第23卷 第1期 页码 167-173 doi: 10.15302/J-SSCAE-2021.01.023
抗生素在畜禽养殖业中发挥了重要保障作用,但畜禽粪便农用后伴生的抗生素耐药性传播风险日益显现,农田土壤抗生素及其耐药基因的风险管控工作亟待开展本文总结了农田土壤中抗生素的污染现状,梳理了农田土壤中新兴污染物抗生素管控存在的问题,提出了农田土壤抗生素及其耐药基因的风险管控建议。研究发现,农田土壤抗生素及其耐药基因的污染风险不可忽视,但抗生素类新兴污染物尚未纳入土壤风险管控范围内。应设立严格的兽药应用监管机制,从养殖源头扼制风险的发生概率;制定有机肥中反映耐药性的控制标准,出台技术指南以规范含抗生素粪便的处置与施用,减少抗生素耐药基因进入环境的总量。同时加紧开展环境抗生素耐药性产生和转移的人类健康风险评估研究,实施农田土壤环境抗生素耐药常规监测,发挥风险评估在该类污染物风险管控工作中的作用。
用于环境催化的MoS2/ZIF-8复合材料——太阳能驱动的抗生素降解工程 Article
陈文倩, 李琳悦, 李林, 裘文慧, 唐量, 徐玲, 许科军, 吴明红
《工程(英文)》 2019年 第5卷 第4期 页码 755-767 doi: 10.1016/j.eng.2019.02.003
关键词: 1T/2H-MoS2 ZIF-8 抗生素降解 光催化
夏照帆,吕开阳,汤陈琪,李骏强
《中国工程科学》 2017年 第19卷 第2期 页码 106-111 doi: 10.15302/J-SSCAE-2017.02.018
陈玲 ,杨潇 ,张琳钰 ,胡海冬 ,王瑾丰 ,吴兵 ,任洪强
《中国工程科学》 2022年 第24卷 第6期 页码 99-106 doi: 10.15302/J-SSCAE-2022.07.003
李凌菲, 毛圆翔, 董慧峪, 王艳, 徐垒, 刘绍刚, 许谦, 强志民, 吉芳英
《工程(英文)》 2023年 第28卷 第9期 页码 16-20 doi: 10.1016/j.eng.2022.05.005
ARGs-OAP v3.0——抗生素耐药基因数据库的筛选和分析流程优化 Article
Xiaole Yin, Xiawan Zheng, Liguan Li, An-Ni Zhang, Xiao-Tao Jiang, Tong Zhang
《工程(英文)》 2023年 第27卷 第8期 页码 234-241 doi: 10.1016/j.eng.2022.10.011
Antibiotic resistance, which is encoded by antibiotic-resistance genes (ARGs), has proliferated to become a growing threat to public health around the world. With technical advances, especially in the popularization of metagenomic sequencing, scientists have gained the ability to decipher the profiles of ARGs in diverse samples with high accuracy at an accelerated speed. To analyze thousands of ARGs in a highthroughput way, standardized and integrated pipelines are needed. The new version (v3.0) of the widely used ARGs online analysis pipeline (ARGs-OAP) has made significant improvements to both the reference database—the structured ARGs (SARG) database—and the integrated analysis pipeline. SARG has been enhanced with sequence curation to improve annotation reliability, incorporate emerging resistance genotypes, and determine rigorous mechanism classification. The database has been further organized and visualized online in the format of a tree-like structure with a dictionary. It has also been divided into sub-databases for different application scenarios. In addition, the ARGs-OAP has been improved with adjusted quantification methods, simplified tool implementation, and multiple functions with userdefined reference databases. Moreover, the online platform now provides a diverse biostatistical analysis workflow with visualization packages for the efficient interpretation of ARG profiles. The ARGs-OAP v3.0 with an improved database and analysis pipeline will benefit academia, governmental management, and consultation regarding risk assessment of the environmental prevalence of ARGs.
关键词: SARG database ARGs-OAP Antibiotic-resistance genes Environmental metagenome Quantification
微生物源性抗菌肽在可持续农业中的生物前景 Review
林书华, 陈选, 陈惠敏, 蔡茜茜, 陈旭, 汪少芸
《工程(英文)》 2023年 第27卷 第8期 页码 222-233 doi: 10.1016/j.eng.2022.08.011
为满足可持续农业发展体系构建的需求,本文开发了一种可用于替代传统抗生素的策略。该策略指出了一种可用作传统抗生素的替代品——抗菌肽(AMPs),其具有广谱抗菌活性和多靶点抗菌机制的特点。
肠道菌群调控的色氨酸代谢改善了D-Gal/LPS诱导的C57BL/6小鼠急性肝衰竭 Article
郑志鹏, 伍莉, 韩玉秋, 陈俊, 朱帅, 姚圆圆, 王保红, 李兰娟
《工程(英文)》 2022年 第14卷 第7期 页码 134-146 doi: 10.1016/j.eng.2020.12.013
越南广平和顺化两省猪场分离副猪嗜血杆菌的抗生素耐药表型和耐药基因之间的相关性研究 Article
Chao Nguyen Van, 张丽君, Tam Vu Thi Thanh, Hung Pham Hoang Son, Tuan Tran Ngoc, 黄琦, 周锐
《工程(英文)》 2020年 第6卷 第1期 页码 40-48 doi: 10.1016/j.eng.2019.10.014
关键词: 副猪嗜血杆菌,抗药性,耐药基因,越南
氯霉素及其产物降解菌群在长期驯化过程中的微生物群落和关键基因演替模式
张家禹, 周开颜, 郭芳亮, 雷华新, 赵仁鑫, 林琳, 李晓岩, 李炳
《工程(英文)》 2023年 第31卷 第12期 页码 59-69 doi: 10.1016/j.eng.2023.07.009
氯霉素(CAP)作为一种广泛存在的新污染物,对水环境中的生态群落产生了负面影响。生物处理广泛应用于水体污染物的去除,而功能微生物的性能决定了其效果。本研究从活性污泥中驯化了一个具有强大CAP降解能力的菌群。对硝基苯甲酸(PNB)和2,2-二氯乙酸(DCA)是CAP生物和化学处理过程中产生的主要产物,它们也分别作为菌群的唯一底物进行长期驯化。宏基因组分析揭示了2.5年驯化过程中微生物群落和关键功能基因的演替模式。经过长期驯化,Sphingomonas、Caballeronia和Cupriavidus分别成为CAP、PNB和DCA降解菌群中的优势菌属,并且它们分别是CAP、PNB和DCA的关键降解菌,它们之间的协同合作实现了CAP的高度矿化。PNB转化为原儿茶酸(PCA),然后通过间位和邻位裂解途径被矿化。通过长期驯化,参与CAP、PNB和DCA代谢的关键功能基因,包括CAP乙酰转移酶、CAP氧化还原酶、卤代酸脱卤酶和原儿茶酸双加氧酶,在菌群中显著富集。本研究还发现pH和碳源对CAP的生物降解效率有显著影响。本研究驯化的菌群和分离的菌株可用作加强CAP、PNB和DCA污染环境生物修复的微生物资源。
红霉素发酵菌渣长期施用对土壤耐药基因的累积影响 Article
韩子铭, 冯皓迪, 栾晓, 沈云鹏, 任立人, 邓留杰, D.G. Joakim Larsson, Michael Gillings, 张昱, 杨敏
《工程(英文)》 2022年 第15卷 第8期 页码 78-88 doi: 10.1016/j.eng.2022.05.011
抗生素发酵生产过程产生的富含有机质的发酵菌渣具有资源化的潜力,但残留的高浓度抗生素限制了其资源化利用。本研究揭示了亚抑制水平红霉素长期暴露对土壤耐药基因产生累积影响的机制,菌渣中抗生素的高效去除和菌渣环境耐药性影响的长期评价对未来菌渣安全处置与资源化利用至关重要。
应对可转移多黏菌素耐药性——饲料添加剂来源的白屈菜红碱具有双重效应 Article
宋黄威, 王雪杨, 张慕琛, 邹之宇, 杨思源, 易甜, 王建峰, 刘德俊, 沈应博, 代重山, 刘志海, Timothy R. Walsh, 沈建忠, 吴聪明, 汪洋
《工程(英文)》 2024年 第32卷 第1期 页码 163-173 doi: 10.1016/j.eng.2023.06.012
金属稳定同位素示踪深部碳循环——机遇与挑战 Review
刘盛遨,李曙光
《工程(英文)》 2019年 第5卷 第3期 页码 448-457 doi: 10.1016/j.eng.2019.03.007
标题 作者 时间 类型 操作
ARGs-OAP v3.0——抗生素耐药基因数据库的筛选和分析流程优化
Xiaole Yin, Xiawan Zheng, Liguan Li, An-Ni Zhang, Xiao-Tao Jiang, Tong Zhang
期刊论文
2018—2019年我国北方地区奶牛临床型乳房炎源肺炎克雷伯菌的分子特征
宋士凯, 何文娟, 杨大伟, Manar Benmouffok, 王瑶, 李基云, 孙城涛, 宋祥彬, 马士珍, 蔡畅, 丁双阳, 吴聪明, 沈张奇, 汪洋
期刊论文
越南广平和顺化两省猪场分离副猪嗜血杆菌的抗生素耐药表型和耐药基因之间的相关性研究
Chao Nguyen Van, 张丽君, Tam Vu Thi Thanh, Hung Pham Hoang Son, Tuan Tran Ngoc, 黄琦, 周锐
期刊论文
红霉素发酵菌渣长期施用对土壤耐药基因的累积影响
韩子铭, 冯皓迪, 栾晓, 沈云鹏, 任立人, 邓留杰, D.G. Joakim Larsson, Michael Gillings, 张昱, 杨敏
期刊论文
张昱:抗生素发酵废水和菌渣的环境耐药性传播风险与阻断(2022年8月31日)
2022年10月17日
会议视频
应对可转移多黏菌素耐药性——饲料添加剂来源的白屈菜红碱具有双重效应
宋黄威, 王雪杨, 张慕琛, 邹之宇, 杨思源, 易甜, 王建峰, 刘德俊, 沈应博, 代重山, 刘志海, Timothy R. Walsh, 沈建忠, 吴聪明, 汪洋
期刊论文