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罗岚蓉,李坚
《中国工程科学》 2015年 第17卷 第6期 页码 65-69
用于细胞活动可调式光遗传学操控的无线程控LED阵列的研究开发
齐元楷,陈俊晔,刘雪纯,周晓旭,樊剑南,申屠平,Olof Idevall-Hagren,许迎科
《工程（英文）》 2018年 第4卷 第6期 页码 745-747 doi: 10.1016/j.eng.2018.08.005
新孢子虫病——分子流行病学及发病机制综述 Review
Asis Khan, Jahangheer S. Shaik, Patricia Sikorski, Jitender P. Dubey, Michael E. Grigg
《工程（英文）》 2020年 第6卷 第1期 页码 10-19 doi: 10.1016/j.eng.2019.02.010
人类蛋白质N-糖基化的十二年全基因组关联研究 Review
Anna Timoshchuk, Sodbo Sharapov, Yurii S. Aulchenko
《工程（英文）》 2023年 第26卷 第7期 页码 17-31 doi: 10.1016/j.eng.2023.03.013
Most human-secreted and membrane-bound proteins have covalently attached oligosaccharide chains, or glycans. Glycosylation influences the physical and chemical properties of proteins, as well as their biological functions. Unsurprisingly, alterations in protein glycosylation have been implicated in a growing number of human diseases, and glycans are increasingly being considered as potential therapeutic targets, an essential part of therapeutics, and biomarkers. Although glycosylation pathways are biochemically well-studied, little is known about the networks of genes that guide the cell- and tissue-specific regulation of these biochemical reactions in humans in vivo. The lack of a detailed understanding of the mechanisms regulating glycome variation and linking the glycome to human health and disease is slowing progress in clinical applications of human glycobiology. Two of the tools that can provide much sought-after knowledge of human in vivo glycobiology are human genetics and genomics, which offer a powerful data-driven agnostic approach for dissecting the biology of complex traits. This review summarizes the current state of human populational glycogenomics. In Section 1, we provide a brief overview of the N-glycan's structural organization, and in Section 2, we give a description of the major blood plasma glycoproteins. Next, in Section 3, we summarize, systemize, and generalize the results from current N-glycosylation genome-wide association studies (GWASs) that provide novel knowledge of the genetic regulation of the populational variation of glycosylation. Until now, such studies have been limited to an analysis of the human blood plasma N-glycome and the N-glycosylation of immunoglobulin G and transferrin. While these three glycomes make up a rather limited set compared with the enormous multitude of glycomes of different tissues and glycoproteins, the study of these three does allow for powerful analysis and generalization. Finally, in Section 4, we turn to genes in the established loci, paying particular attention to genes with strong support in Section 5. At the end of the review, in Sections 6 and 7, we describe special cases of interest in light of new discoveries, focusing on possible mechanisms of action and biological targets of genetic variation that have been implicated in human protein N-glycosylation.
工业5.0——仿生学和合成生物学的关联及内涵 Artical
Peter Sachsenmeier
《工程（英文）》 2016年 第2卷 第2期 页码 225-229 doi: 10.1016/J.ENG.2016.02.015
仿生学(模仿生物特殊本领的学科) 以及合成生物学，将和过去50年的硅芯片一样与工程开发、工业发展产生紧密联系。化学工业已经将白色生物技术应用于新工艺、新材料和资源的可持续利用中。合成生物学也已经应用到第二代生物燃料的发展中，并利用特制的微生物或生物制催化剂获取太阳能。而仿生学在制药、处理工程以及DNA存储领域的市场潜力是巨大的。这些研究将给生物学带来新思考。生物工程将和今天的数字化技术一样驱动创新。本文讨论了生物工程，特别是碳基生物燃料的应用和细胞饰变的技术与风险。大数据、分析学和海量存储将是未来的发展方向。虽然合成生物学在未来50年将和当今的数字化一样普遍且具有革新能力，但是目前它的应用和影响力还处在初级阶段。本文采用了将生物工程发展分为五个阶段(DNA分析、生物回路、最小基因组、原始细胞、异源生物学)的普遍分类方法，阐述了其对安全与保障、工业发展以及生物工程和生物技术作为跨学科领域发展的影响，同时讨论了伦理问题及公众对仿生学和合成生物学结果的公众讨论的重要性
关键词： 仿生学 合成生物学 生物工程 生物传感器 生物燃料 生物武器 虚拟进化 原始细胞 异种细胞 经济意义 工业5.0 德国 中国
促进肝癌致癌活性和细胞代谢的新型介质——miR-516a-3p
芮韬, 张学优, 冯时, 黄海涛, 詹少伟, 谢海洋, 周琳, 郑树森, 凌琪
《工程（英文）》 2022年 第16卷 第9期 页码 162-175 doi: 10.1016/j.eng.2021.07.020
肝细胞肝癌（HCC）是目前最致命的恶性肿瘤之一。在肝癌细胞中，miR-516a-3p 可以通过外泌体进行递送，并增加受体肝癌细胞的致癌活性。此外，为探索miR-516a-3p 致癌的潜在机制，本研究进行了全面的转录组学、蛋白质组学和代谢组学分析。多组学DIABLO分析显示，蛋白质组学和代谢组学数据之间具有密切的相关性和较强的聚类一致性。综合多组学和共富集途径分析表明，miR-516a-3p 可以调节肝癌细胞的代谢途径，特别是嘌呤代谢和嘧啶代谢。总之，本研究发现，miR-516a-3p 可以通过调节细胞代谢和外泌体递送系统
影响相邻细胞，促进肝癌细胞的肿瘤恶性进展。因此，miR-516a-3p可作为肝癌治疗的新分子靶点。
免疫调节细胞生物学及其在急性移植物抗宿主病预防或治疗中的临床应用 Review
Bruce R. Blazar
《工程（英文）》 2019年 第5卷 第1期 页码 98-105 doi: 10.1016/j.eng.2018.11.016
预防和治疗移植物抗宿主病（GVHD）最常见的方法是尝试耗竭或抑制能介导或支持同种异体反应的T细胞；但这会导致T细胞受体功能缺陷，并因此对感染和肿瘤复发高度敏感。通常通过广泛使用反应性抗体来实现耗竭，而功能损坏通常在使用需长期给药（一般为6个月或更长时间）且具有明显副作用的药物后发生，这种药物可能不会导致供体T细胞对耐调节方案且携带宿主同种抗原的细胞产生耐受性（随着对免疫系统稳态认识的深化，我们已能鉴定和表征具有免疫调节功能的细胞群。虽然这种细胞群通常比较少见，但可通过分离和扩增此类细胞的方法在移植后晚期增补供体移植物或进行输注，来抑制GVHD。本文将探讨GVHD模型中的生物学和临床前概念验证，以及现已发展至临床测试阶段的免疫调节细胞疗法对GVHD的疗效。
关键词： 移植物抗宿主病（GVHD） 免疫调节细胞 细胞疗法
时间序列多组学整合分析揭示原代肝细胞体外培养去分化过程伴随非降解性泛素化修饰的增加 Article
姜正一, 孙泽宇, 欧阳晓希, 赵亚磊, 周梦豪, 王保红, 李启睿, 范林骁, 张赛男, 李兰娟
《工程（英文）》 2020年 第6卷 第11期 页码 1302-1314 doi: 10.1016/j.eng.2020.02.011
目前，原代肝细胞（PHC）在各个研究领域被广泛使用，但是由于在体外培养过程中肝细胞特异性功能的迅速退化（即去分化），严重限制了它的应用范围尽管学者已经对PHC的转录调控和全细胞蛋白质组（WCP）进行了广泛研究，但只有为数不多的研究考虑了蛋白质翻译后修饰（PTM）在这一过程中的作用。为了揭示引起PHC去分化的潜在机制，我们收集了在体外培养0 h、6 h、12 h、24 h和48 h的大鼠原代肝细胞样本，对各个时间点细胞样本的转录组、WCP、泛素化蛋白质组和磷酸化蛋白质组进行了定量分析我们的数据包含了原代肝细胞体外培养去分化过程中详细的多组学分析结果，包括2196个蛋白质、2056个泛素化修饰位点和4932个磷酸化修饰位点。综上所述，我们的数据为抑制原代肝细胞体外培养去分化提供了潜在靶点分子及新的见解。
朱保平,马骞,刘凤玉
《中国工程科学》 2007年 第9卷 第6期 页码 43-47
提出了一种新的细胞自动机———二维可控细胞自动机。根据二维可控细胞自动机的性质，提出了一 种具有梯型结构的二维可控细胞自动机的伪随机序列发生方法。新的细胞自动机在对称密 码学中有广泛地应用。
基于转录组学及多尺度生物测定多模态鉴定宣肺败毒方抑制巨噬细胞免疫反应的活性成分 Article
赵璐, 刘豪, 王迎超, 王书芳, 荀得金, 王毅, 程翼宇, 张伯礼
《工程（英文）》 2023年 第20卷 第1期 页码 63-76 doi: 10.1016/j.eng.2021.09.007
标题 作者 时间 类型 操作
新孢子虫病——分子流行病学及发病机制综述
Asis Khan, Jahangheer S. Shaik, Patricia Sikorski, Jitender P. Dubey, Michael E. Grigg
期刊论文
一种使用光学可控生物致动器的微蠕动泵
Eitaro Yamatsuta, Sze Ping Beh, Kaoru Uesugi, Hidenobu Tsujimura, Keisuke Morishima
期刊论文
中国遗传学会基因组编辑分会第二次会员代表大会暨全国学术年会
2019年11月22日
会议信息
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