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2003 2

2001 1

2000 3

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关键词

生物材料 5

COVID-19 4

N-糖基化 3

临床试验 3

免疫球蛋白G 3

干细胞 3

调节性T细胞 3

DNA 2

G蛋白偶联受体 2

人工智能 2

免疫球蛋白 G 2

免疫疗法 2

单克隆抗体 2

即时医疗 2

合成生物学 2

微流控 2

癌症 2

糖基化 2

细胞外基质 2

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中国城市化进程中的粮食安全与风/煤制天然气单细胞蛋白的研究

曹 晨,余 波,顾为东

《中国工程科学》 2015年 第17卷 第3期   页码 107-112

摘要: 随着总人口的持续增加以及城市人口的迅速膨胀,我国未来将会面临严峻的粮食不足问题,尤其以蛋白质为代表的营养物质将会出现严重短缺。本文针对这一问题,提出了以风力发电为能源,以煤制天然气为原料的单细胞蛋白制备新思路,新途径。此方法通过煤制天然气生产单细胞蛋白,既解决了传统煤炭利用中碳排放高、环境负荷大等缺点,实现了煤炭的升级、绿色利用,又解决了利用石油、工农业废弃物生产单细胞蛋白所产生的食品安全性等问题。另外,此方法可实现大规模工业化生产,为解决我国未来蛋白质不足提供一条绿色、高效、切实可行的新途径。

关键词: 城镇化;粮食安全;非并网发电;煤制天然气;单细胞蛋白    

基于集成液体交换的微流控芯片的完整单细胞动态变形测量 Article

Xu Du, Di Chang, Shingo Kaneko, Hisataka Maruyama, Hirotaka Sugiura, Masaru Tsujii, Nobuyuki Uozumi, Fumihito Arai

《工程(英文)》 2023年 第24卷 第5期   页码 94-101 doi: 10.1016/j.eng.2022.08.020

摘要:

本文报道了采用一种集成了力感应和液体交换功能的微流控芯片来测量单细胞力学性能的方法。使用光学镊子操纵和定位在推力探针和力传感器探针之间的单个细胞。这两个芯片上的探针被设计用来捕获和使细胞变形。通过移动由外力驱动的推力探针,而使单个细胞变形。在0.3~0.7 s 内实现液体交换过程,同时也显示了单个细胞的动态变形。可以在30 s 内收集不同渗透浓度下两个杨氏模量值的测量结果以及单个细胞在渗透压冲击下的动态响应。研究了野生型(WT)和突变型集胞藻细胞的动态变形,揭示了机械敏感(MS)通道的功能机制。该系统提供了一种监测单个完整细胞响应快速外部渗透变化的实时力学动力学的新方法;因此,该系统为准确描述细胞中MS通道的生理功能提供了新的机会。

关键词: 微流控芯片     力学性能     动态变形     单细胞     液体交换    

微生物组分析技术的发展趋势:从单细胞功能成像到菌群大数据

徐健, 马波, 苏晓泉, 黄适, 徐欣, 周学东, 黄巍, Rob Knight

《工程(英文)》 2017年 第3卷 第1期   页码 66-70 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.020

摘要: 我们认为在未来五到十年,微生物组的方法学体系在研究理念与技术平台方面将发生三大变革:①从监测菌群“结构”变化向监测菌群“功能/状态”变化的变革;②从细胞“群体”分析精度向细胞“个体”分析精度的转变;③从“数据分析”向“数据科学”的跨越。

关键词: 微生物组     方法学创新     单细胞分析     大数据     中国微生物组计划    

普列克底物蛋白同源物样结构域家族A成员1蛋白——导致代谢疾病的多方面细胞存活因素 Review

Tamana Yousof, Jae Hyun Byun, Jack Chen, Richard C. Austin

《工程(英文)》 2023年 第20卷 第1期   页码 9-18 doi: 10.1016/j.eng.2022.05.014

摘要:

普列克底物蛋白同源物样结构域家族A成员1(PHLDA1)是多作用的胞内蛋白,属于进化上保守的普列克底物蛋白同源相关结构域家族。最初,PHLDA1的小鼠同源基因——T 细胞死亡相关51 基因(TDAG51)——因其在T细胞杂交瘤中活化诱导的细胞凋亡中的作用而被发现越来越多的证据也证实,PHLDA1在内质网应激信号通路中作为细胞凋亡、自噬和增殖的关键介质发挥作用。本文综述了PHLDA1基因及蛋白调控、定位和功能方面的现有知识。

关键词: 内质网应激     代谢     凋亡     细胞存活     普列克底物蛋白同源物样结构域家族A成员1(PHLDA1)    

早期监测肝细胞癌的新型非蛋白生物标志物 Review

Ghassan K. Abou-Alfa, 吴琳, Augusto Villanueva

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第10期   页码 1369-1374 doi: 10.1016/j.eng.2021.02.020

摘要: font-family:等线">细胞癌(HCC)早期检测是对处于早期阶段的肝细胞癌进行检出的方法,对降低高风险患者的HCC死亡率至关重要。

关键词: 细胞    早期检测     生物标志物     液体活检    

基于液滴微流控的分级结构反蛋白石多孔支架用于仿生三维细胞共培养 Article

邵长敏, 刘羽霄, 池俊杰, 叶方富, 赵远锦

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第12期   页码 1778-1785 doi: 10.1016/j.eng.2020.06.031

摘要:

三维(3D)细胞培养具有更好地模拟天然组织特异性的优势,在药物开发、毒性测试和组织工程中发挥着重要作用。然而,现有的3D细胞培养的支架或微载体通常尺寸有限,并且在模拟生物体内血管复合体方面表现不佳。因此,本研究提出了一种通过简单的微流控方法制备的新型分级结构反蛋白石多孔支架,用于促进3D细胞共培养。研究结果表明,该支架能够保证细胞培养过程中的营养供给,从而实现大面积的细胞培养。此外,通过在该支架中连续种植不同的细胞,本文还开发了内皮细胞包裹肝细胞的3D细胞共培养系统,用于构建功能化组织。研究结果表明,该支架用于细胞共培养系统,有助于维持肝细胞特定的体内功能。该分级结构反蛋白石多孔支架为3D细胞培养甚至仿生组织的构建奠定了基础。

关键词: 微流控     蛋白    细胞培养     液滴     生物材料    

单细胞转录组测序鉴定COVID-19外周血重症疾病特异性单核细胞 Article

张研, 王淑婷, 夏鹤, 郭静, 何康信, 黄晨杰, 罗瑞, 陈燕飞, 徐凯进, 高海女, 盛吉芳, 李兰娟

《工程(英文)》 2022年 第17卷 第10期   页码 161-169 doi: 10.1016/j.eng.2021.05.009

摘要:

了解重症新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者单核细胞的免疫学特征(包括与纤维化相关的特征)对了解疾病的重症化机制和阻止疾病恶化至关重要。将以上血样和6例健康对照者血样进行单细胞转录组测序分析。本研究发现在COVID-19重症/危重症时期,单核细胞发生显著变化。单核细胞在外周血单个核细胞中占比增加,多样性却显著降低。同时本研究发现两个新的COVID-19重症疾病特异性单核细胞亚群:Mono 0和Mono 5。本研究同时发现一个疾病重症前期取得的样本显示出与重症/危重症时期样本相似的单核细胞UMAP图谱。本研究发现了两种新的COVID-19重症疾病特异性单核细胞亚群,可作为重症COVID-19的潜在预测因子和治疗靶点。

关键词: COVID-19     重症感染     危重症     单核细胞     纤维化    

基于表位定向细胞库筛选高亲和力PD-1突变体诱骗分子 Article

刘昊, 乔春霞, 胡乃静, 王志宏, 王晶, 冯健男, 沈倍奋, 马远方, 罗龙龙

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第11期   页码 1557-1565 doi: 10.1016/j.eng.2020.11.011

摘要:

抗程序性细胞死亡蛋白-1(programmed cell death protein-1,PD-1)/程序性细胞死亡配体-1(programmed cell death ligand-1, PD-L1)单克隆抗体的免疫疗法已成为治疗肺癌、肠癌和黑色素瘤等多种癌症的常规方法。通过对PD-1及其配体(即PD-L1和PD-L2)或抗体Opdivo的理论结合分析,建立了PD-1的一个小库容量、表位定向的哺乳动物细胞文库。经过三轮细胞分选,筛选出对PD-L1有较高亲和力的PD-1突变体463(亲和力较野生型PD-1提高近3个数量级)。在MC38转基因小鼠模型中,463可有效逆转PD-1对T细胞活化的抑制作用,而且10 mg·kg−1的463突变体蛋白对肿瘤生长的抑制率约为75%,与同等剂量下

关键词: 诱饵程序性细胞死亡蛋白-1     程序性细胞死亡配体-1     哺乳动物细胞文库     表位定向    

信息科学应引领未来的生物医学研究 Perspective

Kenta Nakai

《工程(英文)》 2019年 第5卷 第6期   页码 1155-1158 doi: 10.1016/j.eng.2019.07.023

摘要: 人工智能在历史上一直应用于生物医学,最近的新闻表明,基于人工智能的方法在国际蛋白质结构预测竞争中获得了最佳性能,这可能被视为该领域的另一个里程碑。NGS不仅用于“读取”DNA序列,而且还用于在单细胞水平上获得各种类型的信息。这些数据可以视为气候模拟中的网格数据点。

关键词: 数据科学     人工智能     下一代测序     脱氧核糖核酸     癌症基因组     单细胞转录组学    

水处理仿生膜研究进展

曾艳军,张林,陈欢林

《中国工程科学》 2014年 第16卷 第7期   页码 10-16

摘要:

本文首先介绍了细胞膜中磷脂双分子层与膜蛋白的结构以及水快速传输的机理。在此基础上分别对以膜蛋白、碳纳米管和人造有机纳米孔道为水通道的仿生膜研究进展进行了综述,着重阐述了以膜蛋白为水通道的仿生膜中两性嵌段共聚物基质的优点、规模化制备面临的问题;以碳纳米管为水通道的仿生膜中水快速传输的机理与膜的制备方法

关键词: 细胞    水通道蛋白     仿生膜     碳纳米管     人造水通道    

时间序列多组学整合分析揭示原代肝细胞体外培养去分化过程伴随非降解性泛素化修饰的增加 Article

姜正一, 孙泽宇, 欧阳晓希, 赵亚磊, 周梦豪, 王保红, 李启睿, 范林骁, 张赛男, 李兰娟

《工程(英文)》 2020年 第6卷 第11期   页码 1302-1314 doi: 10.1016/j.eng.2020.02.011

摘要:

目前,原代肝细胞(PHC)在各个研究领域被广泛使用,但是由于在体外培养过程中肝细胞特异性功能的迅速退化(即去分化),严重限制了它的应用范围尽管学者已经对PHC的转录调控和全细胞蛋白质组(WCP)进行了广泛研究,但只有为数不多的研究考虑了蛋白质翻译后修饰(PTM)在这一过程中的作用。为了揭示引起PHC去分化的潜在机制,我们收集了在体外培养0 h、6 h、12 h、24 h和48 h的大鼠原代肝细胞样本,对各个时间点细胞样本的转录组、WCP、泛素化蛋白质组和磷酸化蛋白质组进行了定量分析我们的数据包含了原代肝细胞体外培养去分化过程中详细的多组学分析结果,包括2196个蛋白质、2056个泛素化修饰位点和4932个磷酸化修饰位点。对差异表达的磷酸化修饰蛋白进行功能富集分析,表明该过程中有铁死亡参与。其中,有404种蛋白质同时具有泛素化修饰位点和磷酸化修饰位点,被鉴定为与去分化事件有关的关键蛋白

关键词: 去分化     原代肝细胞     翻译后修饰     泛素化蛋白质组学     磷酸化蛋白质组学     转录组学    

通过蛋白质工程提高聚酯水解酶对PET 塑料的降解效率 Article

马渊, 姚明东, 李炳志, 丁明珠, 何博, 陈思, 周晓, 元英进

《工程(英文)》 2018年 第4卷 第6期   页码 888-893 doi: 10.1016/j.eng.2018.09.007

摘要: 为了更加快速地筛选突变体酶的活性,本研究利用无细胞蛋白表达体系对设计的PETase 突变体进行高通量的表达和验证。因此,本研究通过蛋白质工程对PETase 的关键疏水位点进行设计和改造,获得了降解效果提高的酶突变体,并进一步证实了其生物降解塑料的潜力。

关键词: 聚酯酶     PET降解     细胞蛋白质合成     聚酯     PET酶    

适用于面制品蛋白营养强化的新型大豆蛋白

李荣和,姜浩奎

《中国工程科学》 2003年 第5卷 第3期   页码 72-74

摘要:

采用大豆功效成份连续提取、逆向留存大豆蛋白技术,生产新型大豆浓缩蛋白(纯度≥70%)可将大豆浓缩蛋白成本降至<0.22万元/t,是国内外同类产品成本的1/3,在面粉中添加5%~8%新型大豆浓缩蛋白,可使面制主食中大豆蛋白含量提高3.5%~5.6%,而且可全面改善面制主食的品质,不增加面粉与面制主食的售价。

关键词: 大豆蛋白     浓缩蛋白     高变性    

增强生物工程化的前交叉韧带基质的表面特性用于即时干细胞治疗 Article

Xiaohua Yu, Paulos Y. Mengsteab, Ganesh Narayanan, Lakshmi S. Nair, Cato T. Laurencin

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第2期   页码 153-161 doi: 10.1016/j.eng.2020.02.010

摘要: 在本文中,我们研究了通过纤连蛋白的物理吸附和空气等离子体处理来增强PLLA编织超细纤维基质的细胞黏附性能。我们在三个时间点和三个纤连蛋白浓度下评估了纤连蛋白在基质上的动力学和结合效率。在25 μg·mL–1纤连蛋白溶液中孵育120 min,可实现基质的最大结合效率和细胞黏附性。在纤连蛋白吸附之前将基质置于空气等离子体中处理5 min,可显著增强接种24 h后兔骨髓间充质干细胞(R-BMMSC)的黏附性。最后,监测细胞增殖长达21 d,将基质用空气等离子体处理后,发现纤连蛋白的吸附性导致细胞数量增加。这些发现表明,空气等离子体处理和纤连蛋白吸附可以增强PLLA编织超细纤维基质的细胞黏附性,可改善基质在即时诊疗干细胞疗法中的临床疗效。

关键词: 前交叉韧带     韧带     左旋聚乳酸等离子体处理     纤连蛋白     细胞     黏附性    

中东呼吸综合征病毒(MERS-CoV)蛋白的分子特征、功能及其致病性 Review

李艳华, 胡晨雨, 吴南屏, 姚航平, 李兰娟

《工程(英文)》 2019年 第5卷 第5期   页码 940-947 doi: 10.1016/j.eng.2018.11.035

摘要: 除了完整人免疫球蛋白G(IgG)多克隆抗体(SAB-301)的安全性和耐受性得到一定的验证之外,目前尚无其他针对MERS-CoV的有效的预防性疫苗或抗体特效治疗手段。为此,我们需要明确MERS-CoV各种蛋白的详细信息。在文中论述了MERS-CoV的主要结构蛋白和非结构蛋白,并总结了抑制MERS-CoV感染的各种潜在的策略。

关键词: MERS-CoV     刺突蛋白     结构蛋白     辅助蛋白     非结构蛋白    

标题 作者 时间 类型 操作

中国城市化进程中的粮食安全与风/煤制天然气单细胞蛋白的研究

曹 晨,余 波,顾为东

期刊论文

基于集成液体交换的微流控芯片的完整单细胞动态变形测量

Xu Du, Di Chang, Shingo Kaneko, Hisataka Maruyama, Hirotaka Sugiura, Masaru Tsujii, Nobuyuki Uozumi, Fumihito Arai

期刊论文

微生物组分析技术的发展趋势:从单细胞功能成像到菌群大数据

徐健, 马波, 苏晓泉, 黄适, 徐欣, 周学东, 黄巍, Rob Knight

期刊论文

普列克底物蛋白同源物样结构域家族A成员1蛋白——导致代谢疾病的多方面细胞存活因素

Tamana Yousof, Jae Hyun Byun, Jack Chen, Richard C. Austin

期刊论文

早期监测肝细胞癌的新型非蛋白生物标志物

Ghassan K. Abou-Alfa, 吴琳, Augusto Villanueva

期刊论文

基于液滴微流控的分级结构反蛋白石多孔支架用于仿生三维细胞共培养

邵长敏, 刘羽霄, 池俊杰, 叶方富, 赵远锦

期刊论文

单细胞转录组测序鉴定COVID-19外周血重症疾病特异性单核细胞

张研, 王淑婷, 夏鹤, 郭静, 何康信, 黄晨杰, 罗瑞, 陈燕飞, 徐凯进, 高海女, 盛吉芳, 李兰娟

期刊论文

基于表位定向细胞库筛选高亲和力PD-1突变体诱骗分子

刘昊, 乔春霞, 胡乃静, 王志宏, 王晶, 冯健男, 沈倍奋, 马远方, 罗龙龙

期刊论文

信息科学应引领未来的生物医学研究

Kenta Nakai

期刊论文

水处理仿生膜研究进展

曾艳军,张林,陈欢林

期刊论文

时间序列多组学整合分析揭示原代肝细胞体外培养去分化过程伴随非降解性泛素化修饰的增加

姜正一, 孙泽宇, 欧阳晓希, 赵亚磊, 周梦豪, 王保红, 李启睿, 范林骁, 张赛男, 李兰娟

期刊论文

通过蛋白质工程提高聚酯水解酶对PET 塑料的降解效率

马渊, 姚明东, 李炳志, 丁明珠, 何博, 陈思, 周晓, 元英进

期刊论文

适用于面制品蛋白营养强化的新型大豆蛋白

李荣和,姜浩奎

期刊论文

增强生物工程化的前交叉韧带基质的表面特性用于即时干细胞治疗

Xiaohua Yu, Paulos Y. Mengsteab, Ganesh Narayanan, Lakshmi S. Nair, Cato T. Laurencin

期刊论文

中东呼吸综合征病毒(MERS-CoV)蛋白的分子特征、功能及其致病性

李艳华, 胡晨雨, 吴南屏, 姚航平, 李兰娟

期刊论文