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张羽,马爱进,高利芬,彭海,贾英民,孙宝国
《中国工程科学》 2021年 第23卷 第5期 页码 86-93 doi: 10.15302/J-SSCAE-2021.05.011
微生物作为全世界分布最广且拥有量最多的生物资源，应用领域广泛，具有突出的经济价值和社会价值。以往虽已有众多微生物研究，但限于技术方法无法深入展开，随着微生物检测技术的不断发展，为微生物研究提供了新途径和新方法。本文总结了国内外微生物资源分子鉴定技术的发展及其应用情况，主要有脱氧核糖核酸（DNA）含量测定、核酸杂交技术、DNA 指纹图谱技术、核酸扩增技术、基因芯片技术和高通量测序技术等；梳理了现有微生物资源分子鉴定技术的优缺点；分析了微生物资源分子鉴定技术存在的问题，如依赖于实验室环境，实验结果的重现性、准确性不足，缺乏相应的微生物数据库。为促进我国微生物资源的保护和利用，研究建议，要继续加强对各鉴定技术的研究，建立具有自主知识产权的微生物资源鉴定平台，完善微生物资源数据库等。
宋仲戬,李曼,胡梁斌,王春明,鲁曦,刘开辉,张丽佳,宇岩,吴清平
《中国工程科学》 2021年 第23卷 第5期 页码 79-85 doi: 10.15302/J-SSCAE-2021.05.010
微生物安全是新时期我国社会与经济健康发展的根本保障，是国家粮食安全、公共卫生、社会稳定的重要支撑。本文梳理了我国微生物安全产业发展面临的问题，结合微生物安全产业的政策环境，分析了微生物安全产业的发展需求和现状；在明晰微生物安全产业国内外发展格局的基础上，综合归纳了制约我国致病微生物检测与控制技术创新及应用研发的瓶颈，提出了构建我国微生物安全产业的发展规划。研究建议，强化微生物安全创新研究平台建设；构建微生物安全科学大数据库，以人才建设驱动能力提升；壮大微生物安全龙头企业，以标准规范保障产业发展；强化微生物安全领域的重大系统创新和工程技术研究，探索出我国微生物安全产业的高质量发展路径
周杨,邓名荣,杜娟,宋仲戬,吴清平,朱红惠
《中国工程科学》 2022年 第24卷 第5期 页码 197-206 doi: 10.15302/J-SSCAE-2022.07.007
农业微生物产业作为利用农业微生物资源和生物技术形成的生物科技产业和高增值农业，涉及种植业、养殖业、农业环境等，在保障粮食安全、提升耕地质量本文从微生物肥料、饲用微生物产品、微生物农药、酶制剂微生物产品、农业废弃物资源化利用等方向，梳理了我国农业微生物产业的发展现状，进而总结了农业微生物技术与产业发展趋势；在研判种质资源、技术研究、产品研发、行业标准等农业微生物产业发展面临问题的基础上，提出了布局科研平台专项、建设数据信息系统、加强微生物种业创新、构建法律法规体系等重点举措。建立完善的产业政策体系和相关配套措施，健全农业微生物产业创新体系，孵化参与国际竞争的高科技企业，以此保障我国农业微生物产业高质量发展。
徐健, 马波, 苏晓泉, 黄适, 徐欣, 周学东, 黄巍, Rob Knight
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 66-70 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.020
方法学创新一直是微生物组学研究的核心驱动力。我们认为在未来五到十年，微生物组的方法学体系在研究理念与技术平台方面将发生三大变革：①从监测菌群“结构”变化向监测菌群“功能/状态”变化的变革；②从细胞“群体”分析精度向细胞“个体”分析精度的转变；③从“数据分析”向“数据科学”的跨越。在这里我们针对实现上述三大方法学变革需要克服的关键科学或技术挑战，重点介绍了部分中国微生物组分析方法学研究团队及其国际合作伙伴的最新工作进展。我们相信中国微生物组计划应把握住当前这一重要机遇，通过在微生物组分析方法学前沿开展富有雄心、远见、创意与竞争力的交叉合作研究，为国际微生物组计划贡献一系列“中国制造”的新方法、新工具和新仪器
王保红, 姚铭飞, 吕龙贤, 凌宗欣, 李兰娟
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 71-82 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.008
数以万亿计的微生物寄生于人体表面和体内，并与人类起演变多种环境因素可影响胃肠道微生的平衡，这些改变与人体健康和疾病密切相关本文重点关注人体微生与宿主之间的相互作用，总体概括微生物在人体基本生命过程中以及主要疾病中起的作用我们还综述了微生物研究相关术的重要进展，如DNA 测序、代谢组学和基于计算生物信息学的蛋白质组学目前对人类微生态的研究已经更加复杂和全面建议研究应更多关注–宿主微生物的相互作用和因果关系，这有助于我们更好地了解肠道微生物在人类健康和疾病中的作用
杜娟,马连营,马爱进,刘龙,于晴,吴清平
《中国工程科学》 2021年 第23卷 第5期 页码 51-58 doi: 10.15302/J-SSCAE-2021.05.007
于晴,黄婷婷,邓子新
《中国工程科学》 2021年 第23卷 第5期 页码 69-78 doi: 10.15302/J-SSCAE-2021.05.009
微生物来源的天然产物药物具有结构多样、活性优良等优点，临床应用潜力巨大。本研究系统分析了我国微生物药物产业发展现状，梳理了微生物种质资源利用、优良菌种筛选和发酵工艺优化、菌株工程化改造、新型微生物药物创制等技术趋势，助力我国破解产业瓶颈、加速产业升级。我国现代微生物药物产业已经具备了坚实的资源和技术基础，但与国际领先水平有一定的差距。本研究针对产业面临的机遇与挑战，从建立统筹创新的微生物医药大科学装置、加强微生物药物基础研究和技术自主研发、构建战略性人才引育系统、形成体系化产业激励政策等四个方面提出了发展建议。
湿地芦苇根系微生物群落组成与环境应用 Review
王东麟, 柏耀辉, 曲久辉
《工程（英文）》 2022年 第9卷 第2期 页码 42-50 doi: 10.1016/j.eng.2021.05.016
Tetrasphaera富集的强化生物除磷微生物组的时间动态和效能关联 Article
王慧, 王玉波, 张国庆, 赵泽, 鞠峰
《工程（英文）》 2023年 第29卷 第10期 页码 168-178 doi: 10.1016/j.eng.2022.10.016
基于16S rRNA扩增子测序技术对全球污水处理厂（WWTP）强化生物除磷（EBPR）工艺中微生物群落的研究表明Tetrasphaera是丰度最高的聚磷菌（PAOs）。本文通过“自上而下”的方法利用复合碳源和低浓度烯丙基硫脲构建了Tetrasphaera富集的EBPR微生物组，其16S序列的丰度在第 113 天可达 40%。Tetrasphaera富集的微生物组具有高的营养物去除效率，可以实现约85% 的磷（P）去除和约80%的氮（N）去除，其污泥灰分中的P回收率相较于普通污水处理厂活性污泥提高了 23.2并且显着降低了氨氧细菌Nitrosomonas和PAOs的潜在竞争者 Brevundimonas 和 Paracoccus 的相对丰度，促进了 EBPR 微生物组的建立本研究为通过烯丙基硫脲促进Tetrasphaera富集的微生物组建立提供了新的认知，或可用于指导未来污水处理系统工艺的升级和优化，从而帮助实现高浓度废水的同步脱氮除磷。
毕心宇,吕雪芹,刘龙,陈坚
《中国工程科学》 2021年 第23卷 第5期 页码 59-68 doi: 10.15302/J-SSCAE-2021.05.008
在我国“绿色生产，节能减排”政策的倡导下，微生物制造产业飞速发展，涉及农业、食品、能源、化工等多领域，并产生了良好的经济效益与社会价值本文阐述了全球微生物制造产业的发展态势，分析了我国微生物制造产业在发酵食品、生物肥料、酶制剂、生物基、生物质能领域的发展现状，全面解析我国微生物制造产业发展的机遇与挑战。研究表明，我国微生物制造产业涉及多个领域，研发技术不断改革创新，一些发酵大宗产业生产水平位居世界前列，新菌种新产品持续增多，工业生产规模逐步扩大。与此同时，我国微生物制造产业也面临着核心菌种自主率低，前沿科研技术垄断，关键生产设备依赖进口等挑战。研究建议，我国微生物制造产业应提高自主研发能力，增强产业间的交叉创新，开发智能化工业生产设备，加速科研成果转化和工业化生产，实现我国微生物制造产业的跨越式发展。
流动电极微生物电合成提高产物生成速率及降低能量消耗 Article
褚娜, 王东麟, 王厚锋, 梁勤军, 常佳丽, 高瑜, 蒋永, 曾建雄
《工程（英文）》 2023年 第25卷 第6期 页码 157-167 doi: 10.1016/j.eng.2021.09.015
微生物电合成（microbial electrosynthesis, MES）利用可再生电力驱动微生物固定CO2合成化学品，在推进碳循环经济中具有一定潜力，受到广泛关注。基于PAC的流动电极能够降低水跨膜通量、传质阻力，但是对装置电压、流变行为、乙酸吸附的影响较小。流动电极MES反应器中，能量代谢相关基因高表达，Acetobacterium的丰度增加。
生物质垃圾制沼气技术综述 Review
Spyridon Achinas, Vasileios Achinas, Gerrit Jan Willem Euverink
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第3期 页码 299-307 doi: 10.1016/J.ENG.2017.03.002
当今时代，人类对化石燃料的不合理利用和温室气体对环境的影响，使研究者关注有机资源和垃圾的可持续能源转化。全球的能源需求非常大，主要能源来自化石能源。目前的研究认为厌氧消化是一种高效的可替代技术，其既能产生生物燃料，又能可持续地处理垃圾。在沼气工业，为了促进沼气的生成和提高质量，有几种不同的技术趋势。在欧洲能源市场，沼气的生产一直在增长，为生物能源的发展提供了一条经济的替代选择。本文的目的是对由木质纤维素类的生物垃圾生产沼气进行综述，为沼气经济提供重要信息。
张雷,刘娜,崔红涛,周强,卢小光,赵志宾
《中国工程科学》 2007年 第9卷 第11期 页码 209-212
通过对保定市某印染纺织有限公司印染废水调试过程中微生物的镜检分析，发现在调试过程中微 生物相的变化有一定的规律可循，简单介绍了各个阶段的微生物种群，并对其变化的原因做简单分析，为水 处理调试过程的微生物监测方法提供一些可参考的依据。
氯霉素及其产物降解菌群在长期驯化过程中的微生物群落和关键基因演替模式
张家禹, 周开颜, 郭芳亮, 雷华新, 赵仁鑫, 林琳, 李晓岩, 李炳
《工程（英文）》 2023年 第31卷 第12期 页码 59-69 doi: 10.1016/j.eng.2023.07.009
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